65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2921 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2921  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  hitchhiker  0.00143078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1720  Protein of unknown function DUF2064  67.01 
 
 
222 aa  232  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180381  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3090  glycosyl transferase family 2  52.94 
 
 
459 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148371  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8284  hypothetical protein  52.33 
 
 
222 aa  151  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0980  hypothetical protein  46.81 
 
 
240 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463326  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0725  hypothetical protein  40.48 
 
 
223 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.349017  normal  0.0252948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0711  hypothetical protein  40.48 
 
 
223 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629839  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0705  hypothetical protein  40.48 
 
 
223 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4585  Protein of unknown function DUF2064  39.81 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.780972  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3073  hypothetical protein  35.23 
 
 
228 aa  94.7  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0645315  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10551  hypothetical protein  39.73 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.106742  normal  0.477317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4044  hypothetical protein  33.85 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.610529  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0887  hypothetical protein  39.81 
 
 
221 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2086  hypothetical protein  34.83 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3691  hypothetical protein  33.16 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2980  hypothetical protein  35.55 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0828  hypothetical protein  31.91 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.843877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0485  hypothetical protein  35.05 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3786  hypothetical protein  32.62 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1272  hypothetical protein  29.38 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0643  Protein of unknown function DUF2064  23.81 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2754  hypothetical protein  43.64 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0313072  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2553  hypothetical protein  35.29 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871585  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  30.93 
 
 
422 aa  69.3  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  32.28 
 
 
435 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3859  hypothetical protein  31.98 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0587  hypothetical protein  30.61 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2452  hypothetical protein  30.53 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.593025  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1931  hypothetical protein  30.46 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  hitchhiker  0.000000192623 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1592  hypothetical protein  30.16 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3220  hypothetical protein  31.94 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5331  hypothetical protein  29.95 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1625  putative cytoplasmic protein  32.32 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1770  hypothetical protein  30.69 
 
 
202 aa  62.8  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2226  hypothetical protein  26.32 
 
 
207 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010005  normal  0.316515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2164  hypothetical protein  26.32 
 
 
207 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2624  hypothetical protein  29.38 
 
 
241 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0449895  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1630  hypothetical protein  25.52 
 
 
204 aa  62  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.579739  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0948  hypothetical protein  31 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05025  hypothetical protein  27.23 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3553  hypothetical protein  34.33 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1624  hypothetical protein  31.22 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1992  hypothetical protein  27.18 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0222991  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0588  hypothetical protein  29.38 
 
 
254 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0537069 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1157  hypothetical protein  28.87 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1957  hypothetical protein  30.57 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0272  hypothetical protein  29.44 
 
 
216 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1196  hypothetical protein  27.64 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0127445 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1525  hypothetical protein  26.2 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123596  normal  0.0891134 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0709  hypothetical protein  31.75 
 
 
199 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0571973  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3287  hypothetical protein  28.19 
 
 
270 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.13687  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0754  hypothetical protein  34.31 
 
 
206 aa  56.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1612  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
441 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000415203  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1593  hypothetical protein  28.64 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2120  Protein of unknown function DUF2064  28.17 
 
 
568 aa  53.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.413688 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08281  hypothetical protein  28.57 
 
 
220 aa  51.6  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0968  hypothetical protein  29.1 
 
 
290 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.274374  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3383  hypothetical protein  32.62 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0661  Protein of unknown function DUF2064  28.88 
 
 
217 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0604408 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47585  predicted protein  26.34 
 
 
271 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34390  hypothetical protein  28.27 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0014  hypothetical protein  28.64 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.578692  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05901  hypothetical protein  23.27 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.144524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4898  hypothetical protein  28.37 
 
 
243 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00468998  decreased coverage  0.000700285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>