35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1523 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1523  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
220 aa  440  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  48.87 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06240  lysophospholipase L1-like esterase  43.75 
 
 
216 aa  159  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0436  GDSL family lipase  37.9 
 
 
208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.633376  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2048  lipolytic protein G-D-S-L family  34.4 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.137191 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  38.46 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1486  lipolytic protein G-D-S-L family  32.87 
 
 
264 aa  114  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.585939  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3980  lipolytic protein G-D-S-L family  33.19 
 
 
262 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235003  normal  0.737943 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0553  lipolytic protein G-D-S-L family  27.75 
 
 
214 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2692  lipolytic protein G-D-S-L family  31.67 
 
 
217 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0650  GDSL family lipase  29.52 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2599  lipolytic protein G-D-S-L family  30.49 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0443  GDSL family lipase  28.57 
 
 
213 aa  85.1  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.665716  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0794  lipolytic protein G-D-S-L family  30.05 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.774781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  28.91 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  30.43 
 
 
327 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0275  lipolytic protein G-D-S-L family  27.27 
 
 
220 aa  62  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.360284  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.43 
 
 
327 aa  58.2  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.43 
 
 
329 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  30.77 
 
 
322 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0817  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 
331 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788434 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  26.23 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0828  lipolytic enzyme, G-D-S-L  23.91 
 
 
500 aa  49.7  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0189609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4821  lipolytic protein G-D-S-L family  22.22 
 
 
456 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000350884  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4377  putative lipase  22.12 
 
 
238 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  25.47 
 
 
261 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  28.43 
 
 
318 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  26.44 
 
 
261 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2606  lipolytic protein G-D-S-L family  22.22 
 
 
457 aa  45.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00170788  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.77 
 
 
303 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  24.54 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  30.22 
 
 
283 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0191  GDSL family lipase  30.43 
 
 
201 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3660  lipolytic protein G-D-S-L family  26.82 
 
 
422 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000531698  hitchhiker  0.0000015866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  25.62 
 
 
258 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>