More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5797 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5797  amidohydrolase  100 
 
 		 491 aa  1004    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0417  amidohydrolase  38.89 
 
 		 483 aa  317  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2387  amidohydrolase  36.94 
 
 		 483 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2475  amidohydrolase  37.42 
 
 		 490 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.6 
 
 		 441 aa  183  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  27.48 
 
 		 434 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  31.69 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.33 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  27.79 
 
 		 447 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  31.49 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  28.81 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  27.65 
 
 		 431 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0817  amidohydrolase  31.81 
 
 		 464 aa  156  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  28.63 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  27.7 
 
 		 468 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  26.78 
 
 		 431 aa  153  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.29 
 
 		 434 aa  150  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  25.77 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  26.58 
 
 		 431 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  25 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  28.76 
 
 		 656 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.05 
 
 		 445 aa  143  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.356182 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  30.37 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  27.96 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  24.63 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  27.93 
 
 		 663 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  24.52 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3129  amidohydrolase  30.33 
 
 		 434 aa  136  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.611034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1698  amidohydrolase family protein  27.72 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  24.79 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  27.19 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  23.61 
 
 		 462 aa  133  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  27.41 
 
 		 663 aa  133  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2960  amidohydrolase  26.77 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  26.1 
 
 		 431 aa  131  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  26.53 
 
 		 461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0728  putative hydrolase  27.08 
 
 		 443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951469  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  29.37 
 
 		 442 aa  129  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  24.38 
 
 		 434 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5431  chlorohydrolase  25.65 
 
 		 466 aa  128  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225763  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  27.25 
 
 		 442 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0206  hypothetical protein  27.18 
 
 		 466 aa  126  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2201  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.6 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.419012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3159  amidohydrolase  28.22 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462314 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3238  amidohydrolase  26.7 
 
 		 444 aa  124  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  30.3 
 
 		 445 aa  123  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1931  amidohydrolase  26.11 
 
 		 440 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.64184  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  27.35 
 
 		 444 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2283  amidohydrolase  26.72 
 
 		 473 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.03 
 
 		 470 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  25.95 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.03 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  26.62 
 
 		 435 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  25.71 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  26.62 
 
 		 435 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  26.62 
 
 		 435 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.11 
 
 		 484 aa  118  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4866  amidohydrolase  24.75 
 
 		 660 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  26.42 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.11 
 
 		 451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.61 
 
 		 470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.03 
 
 		 470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.61 
 
 		 470 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.61 
 
 		 470 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2068  amidohydrolase  27.21 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.957525  normal  0.0189876 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  26.4 
 
 		 435 aa  117  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  26.19 
 
 		 426 aa  117  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  26.17 
 
 		 435 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  26.4 
 
 		 435 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  26.4 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  26.4 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.4 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.93 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  24.75 
 
 		 462 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  27.71 
 
 		 451 aa  114  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  27.61 
 
 		 432 aa  113  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6058  amidohydrolase  26.64 
 
 		 479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535728  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  27.35 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1235  amidohydrolase  27.02 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0610028  normal  0.415646 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11770  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  25.23 
 
 		 449 aa  111  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  23.78 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  24.07 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1506  amidohydrolase  27.21 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111511  normal  0.058245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.44 
 
 		 444 aa  110  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  23.56 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  25.42 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.93 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  24.89 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  26.22 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2080  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.86 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.74 
 
 		 465 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  25 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23240  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.03 
 
 		 444 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00576591 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0947  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.33 
 
 		 441 aa  107  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  25.94 
 
 		 442 aa  107  5e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.78 
 
 		 470 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.91 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.1 
 
 		 476 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.16 
 
 		 500 aa  106  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2138  amidohydrolase  24.69 
 
 		 469 aa  106  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>