More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4680 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 367 aa  739    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  38.2 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  38.63 
 
 		 321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  37.83 
 
 		 365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.29 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.24 
 
 		 367 aa  142  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  38.21 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 352 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 		 1250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  35.86 
 
 		 305 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  38.57 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 		 351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  36.18 
 
 		 347 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  35.37 
 
 		 306 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 		 373 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  36.5 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 		 280 aa  123  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  31.47 
 
 		 332 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 		 363 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 		 1035 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 		 373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  32.9 
 
 		 672 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 		 274 aa  116  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 		 374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  37.74 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.76 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 		 289 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 		 277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 		 380 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 318 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  34.72 
 
 		 340 aa  110  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 		 313 aa  109  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 		 390 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  33.05 
 
 		 255 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.49 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  34.08 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  36.22 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 		 347 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 597 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.24 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 344 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 		 276 aa  106  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.27 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.94 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 		 308 aa  104  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  29.96 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.64 
 
 		 330 aa  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 		 294 aa  103  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 373 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  27.45 
 
 		 353 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 		 275 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3408  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 		 581 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 		 663 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.8 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 345 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.74 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>