29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3800 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  346  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  38.95 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0074  hypothetical protein  34.76 
 
 		 159 aa  87.4  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.863966  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2889  hypothetical protein  40.57 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4533  hypothetical protein  41.1 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2137  putative transmembrane protein  38.69 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280947 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  25.32 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  30.28 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  34.15 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3056  alpha-2 type XI collagen  37.41 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  30.82 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  25 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  34.97 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  28.21 
 
 		 170 aa  50.8  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  31.15 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  31.11 
 
 		 158 aa  48.1  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000307  hypothetical protein  40.58 
 
 		 192 aa  47.8  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  29.06 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0525  hypothetical protein  30.89 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  32.77 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  28.57 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  28.07 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  25 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  26 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  25.6 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1745  hypothetical protein  25.73 
 
 		 238 aa  41.6  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  30 
 
 		 212 aa  41.2  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  29.17 
 
 		 218 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>