52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3232 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  100 
 
 		 102 aa  205  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7897  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  87.21 
 
 		 102 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373381  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8393  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  87.21 
 
 		 102 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4666  RelB antitoxin  81.4 
 
 		 101 aa  141  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0384532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  62.89 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  60.82 
 
 		 98 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  48.81 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  52.56 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  52.56 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  50 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  48.72 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  49.33 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  45.45 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  60 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  60 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  60 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  52.38 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  54.9 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  47.62 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  46.03 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  56.86 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  46.03 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  43.24 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  52.94 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  52.94 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  52.94 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  52.94 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  52.94 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  52.94 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  52.94 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  52.94 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  52.94 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3344  addiction module antitoxin  47.92 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218664  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  46.94 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  47.06 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  44 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1874  addiction module antitoxin  45.1 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  0.190999 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  42.86 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  39.39 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  41.3 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  41.3 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  32.5 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2916  hypothetical protein  53.85 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0139  hypothetical protein  53.85 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  40.82 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0139  hypothetical protein  47.73 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  44.9 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  34.38 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7599  hypothetical protein  39.58 
 
 		 152 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1573  DNA-damage-inducible protein J, putative  27.4 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0246869  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1749  RelB antitoxin  38.3 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00498154  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0966  hypothetical protein  46.34 
 
 		 49 aa  40.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00430801  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>