More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0934 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  100 
 
 
203 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1297  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  70.44 
 
 
206 aa  249  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114938  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  65.26 
 
 
201 aa  248  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0601  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  70 
 
 
201 aa  247  8e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1389  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  68.97 
 
 
206 aa  246  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.942836  normal  0.154079 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0566  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  70 
 
 
201 aa  247  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1760  hypothetical protein  68.32 
 
 
209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1357  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  65.02 
 
 
203 aa  230  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  66.67 
 
 
196 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  64.43 
 
 
196 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3314  hypothetical protein  65.13 
 
 
202 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3514  protein of unknown function DUF205  64.1 
 
 
202 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3637  protein of unknown function DUF205  64.1 
 
 
202 aa  204  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.646526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  65.79 
 
 
197 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0473  hypothetical protein  64.47 
 
 
201 aa  203  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3030  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  67.37 
 
 
196 aa  201  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2284  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  63.78 
 
 
198 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.278877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4727  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  61.17 
 
 
198 aa  194  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  55.28 
 
 
214 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  56.45 
 
 
201 aa  184  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  56.45 
 
 
201 aa  184  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3529  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  59.9 
 
 
203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.536272  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  53.76 
 
 
210 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3856  protein of unknown function DUF205  56.12 
 
 
204 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0565232 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  51.04 
 
 
211 aa  177  9e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  56.68 
 
 
194 aa  175  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1715  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  58.7 
 
 
216 aa  174  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.23261  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4346  hypothetical protein  67.58 
 
 
199 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3917  hypothetical protein  60.82 
 
 
202 aa  167  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  48 
 
 
203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3095  protein of unknown function DUF205  53.01 
 
 
203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0484205  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  51.24 
 
 
212 aa  161  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  46.53 
 
 
224 aa  158  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3420  hypothetical protein  58.55 
 
 
197 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296095  normal  0.610432 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0027  membrane protein  42.55 
 
 
195 aa  157  1e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3192  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  55.1 
 
 
216 aa  155  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1509  hypothetical protein  55.56 
 
 
215 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0007  membrane protein  47.06 
 
 
191 aa  154  7e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.386788  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2062  hypothetical protein  50 
 
 
202 aa  153  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  50.25 
 
 
226 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3073  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  52.53 
 
 
202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1811  hypothetical protein  45.88 
 
 
209 aa  150  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443893  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  51.3 
 
 
203 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0533  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  50.78 
 
 
198 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2521  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.39 
 
 
203 aa  149  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.635021 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.39 
 
 
212 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0517  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.15 
 
 
202 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0870487  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3312  protein of unknown function DUF205  66.18 
 
 
200 aa  147  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0575  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.42 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.42 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2546  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.79 
 
 
207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3467  hypothetical protein  50.78 
 
 
213 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2823  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.53 
 
 
207 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.571241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0155  protein of unknown function DUF205  47.89 
 
 
208 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.337449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2243  protein of unknown function DUF205  46.63 
 
 
211 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.341308  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1208  hypothetical protein  52.97 
 
 
200 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1070  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.94 
 
 
203 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0914  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.94 
 
 
203 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2753  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.67 
 
 
206 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0918  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.94 
 
 
203 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3906  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  50.84 
 
 
203 aa  142  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.676022  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  49.19 
 
 
193 aa  142  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.23 
 
 
210 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  48.65 
 
 
193 aa  141  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2417  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50 
 
 
207 aa  140  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0372  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.94 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  47.89 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2507  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.94 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0121  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.94 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0672  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.94 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0293  hypothetical protein  47.69 
 
 
210 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0729  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.47 
 
 
202 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1851  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.63 
 
 
226 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  48.39 
 
 
195 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0740  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.69 
 
 
212 aa  138  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2382  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.81 
 
 
200 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.332777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  48.09 
 
 
196 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5888  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  49.74 
 
 
212 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2604  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  49.23 
 
 
212 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2475  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  49.23 
 
 
212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0301507 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  45.9 
 
 
194 aa  135  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  42.79 
 
 
216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0040  hypothetical protein  42.78 
 
 
197 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4637  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.6 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1001  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.01 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0144207  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3209  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.19 
 
 
214 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468969  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2760  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  48.92 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1800  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  53.93 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  43.52 
 
 
198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0051  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.49 
 
 
208 aa  132  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00859928  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1043  hypothetical protein  42.64 
 
 
200 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000725883  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4339  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.67 
 
 
196 aa  131  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2985  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.38 
 
 
203 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000527205  normal  0.538474 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2903  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.38 
 
 
203 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000317667  normal  0.0212872 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1158  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.93 
 
 
202 aa  130  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000140033  normal  0.0384563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0541  hypothetical protein  45.11 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1406  protein of unknown function DUF205  43.98 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1109  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.9 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000633116  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0753  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.72 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1290  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.7 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>