More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0196 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0196  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
470 aa  958    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4329  Aminotransferase protein  63.18 
 
 
455 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.617372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0318  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.08 
 
 
455 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213492  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1944  aminotransferase class I and II  56.8 
 
 
455 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.49804  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1111  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.5 
 
 
450 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0567781 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1837  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.83 
 
 
456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1946  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.94 
 
 
457 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.800887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0951  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.51 
 
 
455 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2222  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.94 
 
 
457 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475476  normal  0.501295 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1540  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.2 
 
 
445 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1144  Glycine C-acetyltransferase  52.83 
 
 
453 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1508  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.88 
 
 
445 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3920  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.54 
 
 
450 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.193624  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2728  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.89 
 
 
464 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3875  glycine C-acetyltransferase  51.03 
 
 
442 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264237  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3011  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  50.25 
 
 
441 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1973  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.73 
 
 
544 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2618  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.25 
 
 
441 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3269  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  52.19 
 
 
439 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3283  aminotransferase class-I  52.19 
 
 
439 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1059  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  52.19 
 
 
439 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2164  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  52.19 
 
 
439 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0301  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.77 
 
 
442 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454104  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3233  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  51.93 
 
 
439 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0211359  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2601  glycine C-acetyltransferase  46.94 
 
 
450 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0784  8-amino-7-oxononanoate synthase  50.77 
 
 
442 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0753  glycine C-acetyltransferase  50.77 
 
 
442 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0541  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  52.19 
 
 
439 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1343  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.07 
 
 
440 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144248  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2287  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  52.22 
 
 
390 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3804  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.12 
 
 
444 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.785245 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0641  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.65 
 
 
428 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.367441  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2059  Glycine C-acetyltransferase  45.45 
 
 
440 aa  364  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000332392  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1353  8-amino-7-oxononanoate synthase  48.57 
 
 
409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0795  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.02 
 
 
487 aa  325  8.000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3012  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.58 
 
 
408 aa  318  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  36.7 
 
 
401 aa  256  8e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  37.73 
 
 
396 aa  252  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.2 
 
 
404 aa  247  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.92 
 
 
391 aa  245  9e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.59 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.04 
 
 
395 aa  243  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  37.54 
 
 
395 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.82 
 
 
395 aa  241  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  35.4 
 
 
401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  36.04 
 
 
396 aa  236  6e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  35.56 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  36.15 
 
 
416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.61 
 
 
391 aa  233  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.75 
 
 
393 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4009  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.83 
 
 
398 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0774739  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.9 
 
 
393 aa  229  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.1 
 
 
396 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.73 
 
 
395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0731  Glycine C-acetyltransferase  36.49 
 
 
396 aa  225  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000138233  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.39 
 
 
381 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2298  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.13 
 
 
395 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000248128  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.77 
 
 
393 aa  224  3e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4834  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.1 
 
 
380 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.71 
 
 
381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  35.59 
 
 
446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.79 
 
 
386 aa  223  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.22 
 
 
390 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.34 
 
 
390 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0039  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.27 
 
 
395 aa  222  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.83 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2819  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.14 
 
 
386 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238306 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.17 
 
 
395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01102  Serine palmitoyl transferase subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7ZA40]  34.9 
 
 
672 aa  218  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0709123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.26 
 
 
396 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.07 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0049  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.11 
 
 
396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.24 
 
 
388 aa  217  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.29 
 
 
390 aa  217  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  32.31 
 
 
428 aa  216  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0363  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.29 
 
 
390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.18 
 
 
384 aa  216  8e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0688  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.93 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0048  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  33.68 
 
 
396 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159697 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.48 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.76 
 
 
391 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.69 
 
 
396 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1979  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.33 
 
 
397 aa  213  5.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0814  8-amino-7-oxononanoate synthase  40.64 
 
 
386 aa  213  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.65 
 
 
396 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0748  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.65 
 
 
396 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00398054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.65 
 
 
396 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  33.8 
 
 
403 aa  212  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0675  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.65 
 
 
396 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36128e-18 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4087  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.89 
 
 
389 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0133  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.71 
 
 
392 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0657  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.01 
 
 
396 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4680  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.65 
 
 
396 aa  210  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.721634  hitchhiker  3.77656e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0586  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.38 
 
 
396 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0620  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.38 
 
 
396 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0533  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.01 
 
 
396 aa  209  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.801462  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7064  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.38 
 
 
394 aa  209  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0534  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.38 
 
 
396 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4407  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.33 
 
 
395 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2687  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.08 
 
 
394 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000288731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>