More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3269 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3269  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
439 aa  892    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2287  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  100 
 
 
390 aa  798    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3283  aminotransferase class-I  100 
 
 
439 aa  892    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3875  glycine C-acetyltransferase  89.04 
 
 
442 aa  809    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264237  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3233  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  99.77 
 
 
439 aa  889    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0211359  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1343  8-amino-7-oxononanoate synthase  91.59 
 
 
440 aa  806    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144248  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2164  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
439 aa  892    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0301  8-amino-7-oxononanoate synthase  88.36 
 
 
442 aa  800    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454104  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0753  glycine C-acetyltransferase  88.36 
 
 
442 aa  770    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1144  Glycine C-acetyltransferase  74.78 
 
 
453 aa  677    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0784  8-amino-7-oxononanoate synthase  88.36 
 
 
442 aa  800    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1059  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
439 aa  892    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0541  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 
439 aa  892    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1540  8-amino-7-oxononanoate synthase  58.89 
 
 
445 aa  521  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2601  glycine C-acetyltransferase  58.35 
 
 
450 aa  508  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3920  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.57 
 
 
450 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.193624  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3011  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  55.84 
 
 
441 aa  488  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2618  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.84 
 
 
441 aa  488  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1508  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.07 
 
 
445 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1111  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.63 
 
 
450 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0567781 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2222  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.07 
 
 
457 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475476  normal  0.501295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1944  aminotransferase class I and II  59.54 
 
 
455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.49804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1837  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.48 
 
 
456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1946  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.07 
 
 
457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.800887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0318  8-amino-7-oxononanoate synthase  56.28 
 
 
455 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213492  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0951  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.13 
 
 
455 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1973  8-amino-7-oxononanoate synthase  49.77 
 
 
544 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0641  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.59 
 
 
428 aa  436  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.367441  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2728  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.67 
 
 
464 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0196  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.19 
 
 
470 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4329  Aminotransferase protein  51.43 
 
 
455 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.617372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3804  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.34 
 
 
444 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.785245 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2059  Glycine C-acetyltransferase  47.33 
 
 
440 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000332392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0795  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.85 
 
 
487 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1353  8-amino-7-oxononanoate synthase  45.92 
 
 
409 aa  323  5e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3012  8-amino-7-oxononanoate synthase  42.56 
 
 
408 aa  302  7.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.66 
 
 
404 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.08 
 
 
395 aa  238  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7004  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.64 
 
 
399 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4159  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.47 
 
 
399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.14 
 
 
391 aa  233  5e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  32.91 
 
 
395 aa  233  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3021  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.25 
 
 
399 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4536  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.7 
 
 
399 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  34.96 
 
 
401 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4834  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.5 
 
 
380 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.87 
 
 
395 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.5 
 
 
395 aa  230  3e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3179  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  38.16 
 
 
399 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4087  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.14 
 
 
398 aa  229  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5158  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.43 
 
 
399 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5701  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.43 
 
 
399 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514262 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5321  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.09 
 
 
399 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.41 
 
 
388 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2687  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.38 
 
 
394 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000288731  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4972  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.43 
 
 
399 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4368  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.57 
 
 
398 aa  227  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0071  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.44 
 
 
403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3115  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.43 
 
 
399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601738  normal  0.545145 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4145  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.44 
 
 
403 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4824  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.16 
 
 
398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213173 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.44 
 
 
413 aa  226  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  32.79 
 
 
416 aa  226  8e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  35.52 
 
 
401 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  34.16 
 
 
395 aa  224  3e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.05 
 
 
399 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.65 
 
 
381 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  33.61 
 
 
396 aa  223  6e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4045  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.88 
 
 
398 aa  222  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00116611  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.57 
 
 
381 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.88 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2298  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.1 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000248128  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0088  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.59 
 
 
398 aa  221  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4990  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.59 
 
 
398 aa  221  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00350174  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4121  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.59 
 
 
398 aa  221  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54608  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03475  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.59 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0123868  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03426  hypothetical protein  35.59 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0091  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.59 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.541224  normal  0.282383 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3954  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.59 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0183173  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.37 
 
 
451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3829  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.59 
 
 
398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1598  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.43 
 
 
400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.50805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0484  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.81 
 
 
399 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  36.57 
 
 
396 aa  220  5e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.77 
 
 
393 aa  220  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0908  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.33 
 
 
395 aa  219  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0537628  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0352  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.51 
 
 
393 aa  219  7e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.81 
 
 
391 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.82 
 
 
390 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3945  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.9 
 
 
398 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0731  Glycine C-acetyltransferase  35.11 
 
 
396 aa  218  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000138233  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2093  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.13 
 
 
391 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0005  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.36 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0006  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.36 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.432129  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1431  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.36 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1151  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.36 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326917  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0118  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.46 
 
 
398 aa  217  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1510  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.36 
 
 
399 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0574329  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3989  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.31 
 
 
398 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.879002  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3927  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.31 
 
 
398 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>