More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3920 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3920  8-amino-7-oxononanoate synthase  100 
 
 		 450 aa  917    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.193624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1540  8-amino-7-oxononanoate synthase  67.65 
 
 		 445 aa  630  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2601  glycine C-acetyltransferase  67.12 
 
 		 450 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2618  8-amino-7-oxononanoate synthase  61.12 
 
 		 441 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3011  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  61.12 
 
 		 441 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1144  Glycine C-acetyltransferase  59.51 
 
 		 453 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3875  glycine C-acetyltransferase  58.86 
 
 		 442 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0301  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.28 
 
 		 442 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0784  8-amino-7-oxononanoate synthase  59.28 
 
 		 442 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0753  glycine C-acetyltransferase  59.5 
 
 		 442 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0541  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  57.57 
 
 		 439 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3283  aminotransferase class-I  57.57 
 
 		 439 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3269  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  57.57 
 
 		 439 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1059  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  57.57 
 
 		 439 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2164  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  57.57 
 
 		 439 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3233  putative 8-amino-7-oxononanoate synthase  57.34 
 
 		 439 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0211359  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1343  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.53 
 
 		 440 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144248  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1508  8-amino-7-oxononanoate synthase  57.45 
 
 		 445 aa  488  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2287  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  61.92 
 
 		 390 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1973  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.12 
 
 		 544 aa  477  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1837  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.5 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2222  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.44 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475476  normal  0.501295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1946  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.7 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.800887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0951  8-amino-7-oxononanoate synthase  54.79 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1111  8-amino-7-oxononanoate synthase  52.75 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0567781 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0196  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.54 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0641  8-amino-7-oxononanoate synthase  53.2 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.367441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0318  8-amino-7-oxononanoate synthase  55.7 
 
 		 455 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2728  8-amino-7-oxononanoate synthase  51.22 
 
 		 464 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1944  aminotransferase class I and II  54.43 
 
 		 455 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.49804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4329  Aminotransferase protein  49.88 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.617372  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2059  Glycine C-acetyltransferase  48.44 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000332392  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3804  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.73 
 
 		 444 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.785245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0795  8-amino-7-oxononanoate synthase  47.54 
 
 		 487 aa  351  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1353  8-amino-7-oxononanoate synthase  46.26 
 
 		 409 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3012  8-amino-7-oxononanoate synthase  44.54 
 
 		 408 aa  315  7e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  36.71 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  39.39 
 
 		 395 aa  252  8.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.74 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  36.1 
 
 		 401 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.23 
 
 		 393 aa  246  4e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  38.33 
 
 		 395 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.61 
 
 		 395 aa  244  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.27 
 
 		 393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.02 
 
 		 395 aa  236  8e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  36.84 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  37.1 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  37.8 
 
 		 393 aa  234  3e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  32.72 
 
 		 396 aa  232  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.92 
 
 		 404 aa  229  7e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.5 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.97 
 
 		 381 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.69 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.42 
 
 		 395 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.41 
 
 		 381 aa  223  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.69 
 
 		 395 aa  222  9e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  33.81 
 
 		 416 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2298  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.57 
 
 		 395 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000248128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.7 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2967  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.36 
 
 		 396 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3859  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.15 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0048  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.34 
 
 		 396 aa  219  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0484  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.39 
 
 		 399 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.3 
 
 		 391 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4026  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.15 
 
 		 395 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.15 
 
 		 395 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4339  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.15 
 
 		 395 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4834  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.14 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.71 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.39 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0049  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  37.43 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  33.9 
 
 		 446 aa  216  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.42 
 
 		 395 aa  216  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2819  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.29 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238306 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84331  palmitoyl transferase  34.04 
 
 		 566 aa  215  9.999999999999999e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.66 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0352  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.54 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.34 
 
 		 413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  35.18 
 
 		 395 aa  212  1e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0731  Glycine C-acetyltransferase  33.42 
 
 		 396 aa  212  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000138233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1635  Glycine C-acetyltransferase  37.69 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.17443 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.18 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4145  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.82 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7064  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.17 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1311  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.82 
 
 		 402 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.616211  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.57 
 
 		 397 aa  209  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.44 
 
 		 390 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02780  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.17 
 
 		 405 aa  209  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0071  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.92 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0688  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.21 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2658  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.27 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.22 
 
 		 391 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3945  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.97 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0057  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.9 
 
 		 396 aa  207  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.7 
 
 		 388 aa  206  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0680  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.4 
 
 		 385 aa  206  5e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0587  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.7 
 
 		 395 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.68 
 
 		 389 aa  206  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0573  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.7 
 
 		 395 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.709963  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.01 
 
 		 390 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>