53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_4037 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_4037  Rhomboid family protein  100 
 
 		 256 aa  504  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6253 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03495  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  65.42 
 
 		 241 aa  258  7e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2190  rhomboid-like protein  39.9 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0020  Rhomboid family protein  39.61 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.430888  normal  0.257082 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11367  hypothetical protein  38.89 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000159255  normal  0.565329 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0870  rhomboid family protein  36.87 
 
 		 217 aa  95.5  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2355  rhomboid family protein  35.67 
 
 		 225 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05645  hypothetical protein  31.82 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1292  Rhomboid family protein  38.73 
 
 		 218 aa  92  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4290  rhomboid family protein  34.55 
 
 		 225 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2931  hypothetical protein  31.79 
 
 		 209 aa  89  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1968  Rhomboid family protein  33.51 
 
 		 209 aa  88.6  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.579025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3921  rhomboid family protein  31.89 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3833  rhomboid family protein  31.89 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.123516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3847  rhomboid-like protein  31.89 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0816  rhomboid family protein  34.62 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0409  rhomboid family protein  28.87 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.48547  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2687  Rhomboid family protein  32.8 
 
 		 195 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1014  Rhomboid family protein  37.5 
 
 		 211 aa  85.5  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0445  Rhomboid family protein  31.9 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0458  Rhomboid family protein  31.9 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365759  normal  0.0342055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1699  Rhomboid family protein  30.19 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109717  normal  0.288911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4537  Rhomboid family protein  31.33 
 
 		 211 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29150  uncharacterized membrane protein  35 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.77593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1166  rhomboid family protein  36.52 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.270459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2245  Rhomboid family protein  29.12 
 
 		 208 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.927336  normal  0.19661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0999  membrane protein-like protein  32.05 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1835  hypothetical protein  34.73 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.210618 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05140  uncharacterized membrane protein  34.63 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1218  rhomboid-like protein  34.09 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0810  Rhomboid family protein  28.51 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0267  Rhomboid family protein  31.45 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3473  hypothetical protein  30.06 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000477638  normal  0.0111497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0518  rhomboid family protein  38.52 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137461  normal  0.0721678 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1238  Rhomboid family protein  37.31 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294506 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3288  rhomboid family protein  29.79 
 
 		 188 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.419904  normal  0.14136 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0440  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0836383  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0637  rhomboid-like protein  28.67 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1781  rhomboid-like protein protein  30.67 
 
 		 214 aa  62  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.138273  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0886  hypothetical protein  31.21 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0855  hypothetical protein  30.07 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3785  rhomboid family protein  28.72 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1694  rhomboid-like protein  28.16 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.534876  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01334  Rhomboid-like protein  29.17 
 
 		 179 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.902393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3385  rhomboid family protein  32.88 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.861601 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  35.43 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2256  rhomboid-like protein  22.63 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0526301 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2134  rhomboid family protein  25.71 
 
 		 198 aa  45.8  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00873022  decreased coverage  0.000000167975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  30.94 
 
 		 365 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  29.37 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0760  hypothetical protein  30.2 
 
 		 180 aa  42.7  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17631  rhomboid family protein  34.07 
 
 		 193 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  23.13 
 
 		 486 aa  42  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>