73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1961 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1961  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0400694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4419  hypothetical protein  37.27 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3753  hypothetical protein  35.48 
 
 		 217 aa  138  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000391116  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3105  hypothetical protein  36.82 
 
 		 215 aa  138  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000234851  normal  0.527645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4298  hypothetical protein  36.12 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1673  hypothetical protein  37.56 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3382  hypothetical protein  33.48 
 
 		 220 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704087  normal  0.4967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0772  hypothetical protein  32.6 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.252597  normal  0.28705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0154  hypothetical protein  40.65 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0660485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4143  hypothetical protein  30.8 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.409025  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3332  hypothetical protein  29.86 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5729  hypothetical protein  30.91 
 
 		 215 aa  104  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86097  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0840  hypothetical protein  29.46 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25100  hypothetical protein  32.3 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0855  hypothetical protein  37.33 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03421  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00670)  32.5 
 
 		 249 aa  67  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620019  normal  0.0597509 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115115  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08634  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07320)  30.85 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03370  NAD-binding domain 4, putative  34.46 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00577736  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2067  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.76 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.09 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.659696 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0686  hypothetical protein  32.98 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2027  hypothetical protein  29.22 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00928979  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1996  hypothetical protein  34.67 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0605  hypothetical protein  34.67 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0697  hypothetical protein  34.67 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1842  oxidoreductase  28.26 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.348398  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2138  hypothetical protein  28.26 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2105  hypothetical protein  28.26 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2037  hypothetical protein  28.26 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1890  hypothetical protein  28.26 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1852  oxidoreductase  28.26 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2069  hypothetical protein  28.26 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1127  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  36.42 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3282  hypothetical protein  28.26 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.95 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1968  hypothetical protein  37.18 
 
 		 301 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1648  hypothetical protein  30 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4377  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  35.53 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7511  hypothetical protein  32.28 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1220  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  35.1 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0740  hypothetical protein  26.17 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2918  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.21 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1774  semialdehyde dehydrogenase  32.19 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05841  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07320)  27.75 
 
 		 240 aa  48.9  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0802234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2271  semialdehyde dehydrogenase, NAD - binding  33.33 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.26805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0511  hypothetical protein  31.15 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4289  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.99 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.409194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0766  Male sterility-like  34.21 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2520  hypothetical protein  34.34 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0728182  normal  0.0134539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6648  Semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  23.84 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1247  hypothetical protein  34.21 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3890  hypothetical protein  33.73 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.0603426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 		 322 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 		 286 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0602  hypothetical protein  32.74 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1092  hypothetical protein  32.35 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0633  hypothetical protein  32.37 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0595  hypothetical protein  33.1 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.284564  normal  0.058696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0589  hypothetical protein  33.1 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0550  hypothetical protein  32.62 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.440195  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01753  Protein fmp52, mitochondrial Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BCH7]  27.56 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11890  hypothetical protein  34.31 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1789  hypothetical protein  27.21 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.082987 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3204  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.14 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00120492  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 		 306 aa  42.7  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.627598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.41 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>