More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0558 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0558  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
279 aa  564  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.863042  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1249  glycosyl transferase  72.45 
 
 
275 aa  400  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1219  glycosyl transferase family protein  72.08 
 
 
275 aa  397  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.428258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02692  glycosyl transferase  67.64 
 
 
279 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  27.52 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  26.44 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
378 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
308 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
324 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  27.93 
 
 
296 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
289 aa  102  7e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  27.02 
 
 
652 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2391  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
282 aa  99.4  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.337746  normal  0.474802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 
290 aa  99  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
324 aa  95.5  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
298 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 
310 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.43 
 
 
379 aa  92.4  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
324 aa  89.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
336 aa  89.4  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.04 
 
 
355 aa  89.4  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
304 aa  89  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
308 aa  89  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
311 aa  89  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
340 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
329 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
401 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 
313 aa  87  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
324 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 
294 aa  86.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
318 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
319 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 
361 aa  84  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  28.14 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
334 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  30.11 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
679 aa  79.3  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  28.45 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  23.6 
 
 
346 aa  79  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
327 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.66 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
714 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  27 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  22.05 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  24.02 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4004  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
307 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
705 aa  77  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
310 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2693  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
325 aa  77  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
1435 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4373  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
624 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
1268 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  26.41 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  22.55 
 
 
387 aa  75.9  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
841 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
1737 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5047  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.29 
 
 
2401 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0457  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4485  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  27.21 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>