238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4427 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4427  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
420 aa  870    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3524  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.36 
 
 
415 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599539  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6285  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  45.52 
 
 
437 aa  342  8e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000020628  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0352  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.35 
 
 
427 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4453  hypothetical protein  38.53 
 
 
409 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08356  hypothetical protein  36.94 
 
 
409 aa  250  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.402531  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  26.58 
 
 
168 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  30.19 
 
 
182 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  28.89 
 
 
178 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4595  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.19 
 
 
456 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.440333  normal  0.483822 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3390  hypothetical protein  28.93 
 
 
182 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  28.06 
 
 
184 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.24 
 
 
196 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1488  redoxin domain-containing protein  30.14 
 
 
189 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  32.91 
 
 
171 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  29.27 
 
 
184 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0050  redoxin domain-containing protein  32.81 
 
 
180 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.577845  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  27.14 
 
 
160 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.19 
 
 
280 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.24 
 
 
228 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0184  thioredoxin family protein, putative  31.01 
 
 
171 aa  60.5  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3393  redoxin domain-containing protein  25.97 
 
 
172 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.45952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0856  redoxin domain-containing protein  24.43 
 
 
195 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0694544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1098  thioredoxin family protein, putative  27.91 
 
 
184 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  23.49 
 
 
165 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2369  hypothetical protein  28.68 
 
 
365 aa  57.8  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000132593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  25 
 
 
172 aa  56.6  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  27.48 
 
 
396 aa  57  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  26.71 
 
 
172 aa  56.6  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  28.48 
 
 
170 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  26.79 
 
 
174 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0924  cytochrome C biogenesis protein  25.83 
 
 
177 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.9 
 
 
589 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  27.27 
 
 
173 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2627  redoxin domain-containing protein  29.41 
 
 
182 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  24.24 
 
 
173 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0893  cytochrome C biogenesis protein  25.83 
 
 
177 aa  55.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  24.66 
 
 
622 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  24.67 
 
 
604 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3250  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  27.16 
 
 
190 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.54 
 
 
184 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0509  redoxin domain-containing protein  29.46 
 
 
184 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
609 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  25 
 
 
182 aa  55.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  24.24 
 
 
173 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3690  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  28.57 
 
 
183 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0533  redoxin domain-containing protein  29.46 
 
 
183 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  25.33 
 
 
691 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0124  redoxin  29.46 
 
 
182 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.909527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0607  redoxin domain-containing protein  29.46 
 
 
182 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1036  Redoxin domain protein  28.07 
 
 
196 aa  53.9  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.88 
 
 
390 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.245531  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  26.67 
 
 
174 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  24.2 
 
 
576 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.17 
 
 
168 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0576  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
183 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.37 
 
 
179 aa  53.9  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2982  hypothetical protein  27.42 
 
 
174 aa  53.5  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.138377  normal  0.0639379 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3354  putative thioredoxin-related transmembrane protein  25.19 
 
 
188 aa  53.1  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.24257  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  28.28 
 
 
184 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.97 
 
 
173 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.21 
 
 
598 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0451  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  28.46 
 
 
180 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.33 
 
 
178 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1493  redoxin domain-containing protein  25.98 
 
 
190 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2950  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.56 
 
 
195 aa  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.2 
 
 
447 aa  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.404766  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.67 
 
 
619 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.67 
 
 
619 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.67 
 
 
619 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3640  redoxin domain-containing protein  25.56 
 
 
195 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.851507  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  28.77 
 
 
178 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  26.92 
 
 
173 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.37 
 
 
171 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  27.78 
 
 
469 aa  51.6  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  21.94 
 
 
173 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  22.81 
 
 
167 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.19 
 
 
174 aa  50.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.5 
 
 
175 aa  50.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.33 
 
 
626 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
182 aa  51.2  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  22.14 
 
 
173 aa  50.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  25.68 
 
 
623 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  27.4 
 
 
581 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  29.91 
 
 
178 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  25.76 
 
 
173 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2499  thioredoxin family protein, putative  25.66 
 
 
186 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129809  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  25.76 
 
 
173 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0420  putative thioredoxin family protein  25.66 
 
 
186 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1279  putative thioredoxin family protein  25.66 
 
 
186 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3285  putative thioredoxin family protein  25.66 
 
 
186 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2372  hypothetical protein  28.25 
 
 
202 aa  50.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000519623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  25.76 
 
 
173 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  24.87 
 
 
193 aa  50.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.42 
 
 
201 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  25.76 
 
 
173 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3463  thioredoxin family protein  25.66 
 
 
186 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3501  thioredoxin family protein  25.66 
 
 
186 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511578  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  24.84 
 
 
174 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2082  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.46 
 
 
380 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>