65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4453 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4453  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  852    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0352  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.48 
 
 
427 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4427  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.53 
 
 
420 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3524  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.19 
 
 
415 aa  249  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599539  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6285  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.13 
 
 
437 aa  237  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000020628  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08356  hypothetical protein  34.24 
 
 
409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.402531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4595  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.72 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.440333  normal  0.483822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.25 
 
 
201 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3390  hypothetical protein  26.45 
 
 
182 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2869  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.16 
 
 
200 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  31.9 
 
 
237 aa  53.5  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  29.36 
 
 
180 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3240  redoxin domain-containing protein  29.37 
 
 
198 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3537  Redoxin domain protein  25.16 
 
 
182 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.694899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3473  Redoxin domain protein  25.16 
 
 
178 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576052  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1818  redoxin domain-containing protein  27.97 
 
 
165 aa  53.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.165387  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5746  redoxin domain-containing protein  33.6 
 
 
188 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487229  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  32.82 
 
 
188 aa  50.8  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1054  thioredoxin  23.01 
 
 
173 aa  50.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2682  thioredoxin  28.08 
 
 
183 aa  50.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  23.33 
 
 
168 aa  49.7  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1680  thioredoxin family protein  24.5 
 
 
173 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0732573  normal  0.832163 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0689  Redoxin domain protein  28.38 
 
 
188 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0960762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32 
 
 
178 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0089  Redoxin domain protein  25.81 
 
 
215 aa  48.9  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3455  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.03 
 
 
168 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.61185  normal  0.0436894 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  25 
 
 
160 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2369  hypothetical protein  25.16 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000132593  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0243  redoxin domain-containing protein  23.21 
 
 
184 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.487537  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0052  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.39 
 
 
200 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0866  redoxin domain-containing protein  27.21 
 
 
200 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141982  normal  0.0297264 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1860  cytochrome c biogenesis protein, thiol-disulfide interchange protein  31.54 
 
 
173 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.66 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.245531  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  28.57 
 
 
193 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  27.5 
 
 
174 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1036  Redoxin domain protein  30.21 
 
 
196 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  22.76 
 
 
167 aa  47  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  26.58 
 
 
174 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2000  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
173 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3393  redoxin domain-containing protein  27.59 
 
 
172 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.661206  normal  0.45952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  25 
 
 
191 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  27.56 
 
 
169 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1981  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
171 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0214492  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0520  periplasmic protein thiol  25.13 
 
 
199 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.797158  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  24.59 
 
 
164 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2085  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
173 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  23.57 
 
 
166 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3819  redoxin domain-containing protein  23.02 
 
 
155 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0554152  hitchhiker  0.000365745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0204  periplasmic protein thiol/disulphide oxidoreductase DsbE  28.57 
 
 
198 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.466624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2219  redoxin domain-containing protein  23.68 
 
 
171 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.231269  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  23.68 
 
 
184 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2982  hypothetical protein  25.34 
 
 
174 aa  43.9  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.138377  normal  0.0639379 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0860  Redoxin domain protein  26.79 
 
 
162 aa  43.9  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00216693  normal  0.0861373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2812  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.41 
 
 
240 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2082  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.21 
 
 
380 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1098  thioredoxin family protein, putative  28.36 
 
 
184 aa  43.5  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  22.6 
 
 
182 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1561  thioredoxin  24.82 
 
 
164 aa  43.9  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00616006  normal  0.258468 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  28.68 
 
 
211 aa  43.5  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.59 
 
 
589 aa  43.5  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2673  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.6 
 
 
204 aa  43.1  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  29.57 
 
 
189 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0365  periplasmic protein thiol  26.25 
 
 
197 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  30.89 
 
 
396 aa  43.1  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.56 
 
 
179 aa  43.1  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>