48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3134 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3134  cytochrome c, class I  100 
 
 		 129 aa  263  8e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4773  cytochrome c class I  59.09 
 
 		 669 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3610  hypothetical protein  53.09 
 
 		 180 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.853045 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3236  cytochrome c class I  58.75 
 
 		 647 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0631004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2205  cytochrome c class I  50.53 
 
 		 656 aa  100  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6271  cytochrome c class I  52.5 
 
 		 663 aa  98.2  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000987167  normal  0.709184 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0718  cytochrome c class I  53.16 
 
 		 457 aa  89.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1693  cytochrome c class I  36.7 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.504006 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0430  hypothetical protein  32.5 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  6.67584e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  33.03 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0629  putative oxidoreductase cytochrome C552 precursor signal peptide protein  31.63 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  39.24 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1504  cytochrome c, class I  40 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3648  cytochrome c class I  35.9 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2050  cytochrome c, class I  33.98 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0434258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0985  cytochrome c class I  38.75 
 
 		 101 aa  49.7  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1069  cytochrome c, class I  38.75 
 
 		 101 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1037  cytochrome c class I  32.56 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.692369 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3220  cytochrome c, class I  37.84 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294896  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  34.15 
 
 		 208 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  34.94 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2879  cytochrome c, class I  35.51 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.578668 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5897  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  29 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0342  cytochrome c, class I  29.82 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.16869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 1151 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  33.66 
 
 		 355 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  29.63 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  30 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2222  cytochrome c class I  30.12 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2512  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1386  cytochrome c551/c552-like protein  32.47 
 
 		 118 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660069  normal  0.798955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2122  cytochrome c class I  36.25 
 
 		 131 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3256  cytochrome c, class I  31.33 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2536  cytochrome c class I  35.62 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0728  cytochrome c, class I  24.47 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0783308 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  28 
 
 		 344 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3424  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  51.72 
 
 		 918 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3171  cytochrome c, class I  32.94 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2011  hypothetical protein  32.31 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2380  cytochrome c class I  32.05 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  28.4 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1163  cytochrome c class I  36.99 
 
 		 197 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000127727  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  27.93 
 
 		 645 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5794  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5011  cytochrome c, class I  34.62 
 
 		 101 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>