47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3057 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3057  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  586  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3058  hypothetical protein  83.39 
 
 
289 aa  495  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  31.42 
 
 
322 aa  94.7  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0898  hypothetical protein  25.27 
 
 
283 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148019 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1070  hypothetical protein  25.61 
 
 
287 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1763  hypothetical protein  27.76 
 
 
300 aa  89.4  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0148846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  27.74 
 
 
288 aa  89  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0886  transposase and inactivated derivative  29.07 
 
 
310 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615238  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  31.16 
 
 
296 aa  85.9  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1737  hypothetical protein  28.9 
 
 
318 aa  85.9  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033036 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  31.16 
 
 
300 aa  85.9  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1830  hypothetical protein  25.69 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00791791  hitchhiker  0.0000000000564838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  26.78 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  28.26 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  25.32 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  27.21 
 
 
288 aa  63.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0296  hypothetical protein  26.07 
 
 
303 aa  60.8  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0337026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  26.86 
 
 
299 aa  59.7  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0627  hypothetical protein  26.07 
 
 
298 aa  58.9  0.00000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.261327  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  22.57 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  21.18 
 
 
296 aa  53.5  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0007  hypothetical protein  21.83 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  25.57 
 
 
284 aa  53.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  22.92 
 
 
303 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  26.47 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2560  hypothetical protein  20.64 
 
 
282 aa  50.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  22.83 
 
 
300 aa  49.3  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  27.23 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  24.55 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  25.36 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  26.09 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  25.81 
 
 
314 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  22.92 
 
 
292 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  25.2 
 
 
302 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  25 
 
 
284 aa  46.6  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  22.45 
 
 
307 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0885  hypothetical protein  23.98 
 
 
183 aa  45.8  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688729 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0101  hypothetical protein  26.49 
 
 
298 aa  45.8  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0158  hypothetical protein  27.15 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.459825  hitchhiker  4.24073e-17 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  23.71 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  24.41 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  24.43 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  25.93 
 
 
313 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  25.56 
 
 
326 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0766  hypothetical protein  22.22 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  24.08 
 
 
308 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0528  hypothetical protein  24.38 
 
 
311 aa  42.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.261127  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>