More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2545 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  100 
 
 
386 aa  778    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5101  cyclic nucleotide-binding protein  52.74 
 
 
378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  35.15 
 
 
377 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  31.99 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2282  putative acyltransferase  31.83 
 
 
418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  31.34 
 
 
386 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0745  acyltransferase 3  30.65 
 
 
381 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  27.49 
 
 
396 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  29.29 
 
 
392 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6866  acyltransferase 3  31.88 
 
 
361 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  27.16 
 
 
366 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1161  acyltransferase 3  29.5 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  26.57 
 
 
367 aa  98.6  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  29.72 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  29.92 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4595  acyltransferase 3  38.73 
 
 
358 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6049  acyltransferase 3  43.92 
 
 
423 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.334278 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4389  acyltransferase 3  29.44 
 
 
372 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3978  acyltransferase 3  29.44 
 
 
372 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642758  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3551  acyltransferase 3  28.72 
 
 
372 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39287  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  31.5 
 
 
364 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  29.06 
 
 
383 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  29.12 
 
 
695 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4604  acyltransferase 3  27.61 
 
 
372 aa  89.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  32.01 
 
 
372 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  31.4 
 
 
679 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  31.68 
 
 
376 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3369  acyltransferase 3  29.79 
 
 
372 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  28.37 
 
 
408 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  29.16 
 
 
383 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  28.86 
 
 
587 aa  87  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0700  acyltransferase family protein  28.46 
 
 
437 aa  87  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.926657  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1071  acyltransferase 3  32.42 
 
 
366 aa  87  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.710446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3303  acyltransferase 3  28.72 
 
 
389 aa  86.7  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198239  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  30.29 
 
 
380 aa  86.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  28.03 
 
 
604 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  28.03 
 
 
604 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3864  acyltransferase 3  31.66 
 
 
354 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1056  acyltransferase 3  26.8 
 
 
561 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  37.06 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3359  acyltransferase 3  31.66 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  28.7 
 
 
660 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  33.63 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  39.35 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  28.92 
 
 
660 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  27.99 
 
 
660 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  27.9 
 
 
622 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3407  acyltransferase 3  29.86 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4250  acyltransferase 3  29.48 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330616  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  26.44 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4116  acyltransferase 3  29.48 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  27.15 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3871  acyltransferase 3  37.5 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.833445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2107  acyltransferase 3  37.34 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.278583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  27.69 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3558  acyltransferase 3  32.68 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0624798  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4586  acyltransferase 3  31.38 
 
 
385 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0254963  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3971  acyltransferase 3  30.03 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181677  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1701  acyltransferase family protein  26.58 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0550  acyltransferase family protein  26.58 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1879  acyltransferase family protein  26.58 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1670  acyltransferase family protein  27.69 
 
 
585 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.602851  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  37.91 
 
 
671 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2114  acyltransferase 3  31.92 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  30.96 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  36.81 
 
 
635 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.98 
 
 
656 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1708  acyltransferase family protein  35.94 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110061  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2294  putative acyltransferase  35.94 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0541  acyltransferase family protein  35.94 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.514154  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0757  acyltransferase family protein  35.94 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156053  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  25.32 
 
 
632 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1869  acyltransferase family protein  35.94 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2433  putative acyltransferase  35.94 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142422  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1661  acyltransferase family protein  35.94 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2420  putative acyltransferase  28 
 
 
467 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  34.12 
 
 
665 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  36.36 
 
 
658 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4712  acyltransferase 3  37.58 
 
 
680 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357932  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  28.01 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  34.12 
 
 
684 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4418  acyltransferase 3  37.58 
 
 
681 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4332  acyltransferase 3  37.58 
 
 
681 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0185386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2282  putative acyltransferase  28 
 
 
461 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  29.34 
 
 
710 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  37.74 
 
 
671 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0174  acyltransferase-like  25.56 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  29.34 
 
 
710 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  36.07 
 
 
675 aa  74.7  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0747  acyltransferase family protein  27.86 
 
 
697 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.852579  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  27.48 
 
 
643 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  27.72 
 
 
662 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  26.68 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.09 
 
 
616 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  34.25 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  34.18 
 
 
696 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  29.23 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  24.94 
 
 
435 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  26.42 
 
 
695 aa  73.2  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  28.37 
 
 
667 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>