31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1875 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1875  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  303  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5766  hypothetical protein  54.76 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4466  hypothetical protein  54.62 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3757  hypothetical protein  55.86 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.639836  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  35.96 
 
 		 321 aa  88.6  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08091  hypothetical protein  40.37 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1598  hypothetical protein  45.36 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1841  Thioredoxin domain  32.48 
 
 		 314 aa  68.2  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.928879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1422  hypothetical protein  33 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501791  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0166  hypothetical protein  35.42 
 
 		 350 aa  63.5  0.0000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0134966  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0161  hypothetical protein  31.63 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00228251  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1484  hypothetical protein  35.48 
 
 		 339 aa  58.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  28.03 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  27.52 
 
 		 357 aa  52  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  29.13 
 
 		 176 aa  51.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3686  restriction endonuclease  39.02 
 
 		 421 aa  50.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  26.32 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2057  hypothetical protein  27.91 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  25.76 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.04 
 
 		 376 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436525  normal  0.0576264 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7011  Thioredoxin domain protein  29.01 
 
 		 326 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817681  normal  0.78664 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1456  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  29.46 
 
 		 406 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4066  Thioredoxin domain protein  26.85 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1730  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.75 
 
 		 600 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04218  lipoprotein, putative  27.88 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  25.19 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2777  redoxin domain-containing protein  28.32 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.769829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  27.97 
 
 		 611 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1631  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.32 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4583  thiol-disulfide isomerase  25.53 
 
 		 176 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1658  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.32 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>