71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19600 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19600  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  397  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3147  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  68.21 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587348  hitchhiker  0.00464713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5536  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.29 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.02 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2882  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.67 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156757  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1252  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.34 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1277  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.34 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.184378 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1725  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.67 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1580  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.12 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12737  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1352  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.31 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.642809  normal  0.111178 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0892  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.31 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1374  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.31 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0055276  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0174  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.44 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3064  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.55 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.097831  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2777  phosphatidylglycerophosphate synthase  28.21 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.786395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1623  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.1 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2879  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.77 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  27.1 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326145  normal  0.231246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5154  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.35 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113865  decreased coverage  0.000103616 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2359  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.45 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4519  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1362  CDP-diacylglycerol inositol 3-phosphatidyltransferase  28.87 
 
 		 265 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1447  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.04 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000162704  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.65 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1355  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.43 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.71041  normal  0.214701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4011  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.25 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3841  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.06 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2074  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.35 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.922495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3513  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.77 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0430214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01375  hypothetical protein  31.63 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1491  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.63 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01363  predicted inner membrane protein  31.63 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06020  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.59 
 
 		 230 aa  48.5  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2343  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.71 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1764  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  31.63 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464665  hitchhiker  0.000964827 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2237  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.1 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.282734  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1126  hypothetical protein  26.62 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0010  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.25 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1287  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  26.51 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0130341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3084  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.51 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855556  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1391  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  41.28 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.662517  hitchhiker  0.00035303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4177  hypothetical protein  31.68 
 
 		 238 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.717128  normal  0.427947 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2103  putative membrane transferase  30.05 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.230383  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2100  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.14 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207718  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2209  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  24.63 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000779527  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1981  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.27 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243953 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3006  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  25.9 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171368  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2041  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.43 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000224281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31700  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.38 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.12 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1589  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  30.61 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3953  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.04 
 
 		 246 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377906  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2560  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.46 
 
 		 223 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1250  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.3 
 
 		 203 aa  45.1  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2696  putative CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.81 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0868  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.16 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000176842  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1225  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  32.56 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3186  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.94 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.747561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0065  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.08 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.364844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6126  CDP-alcohol phosphatidyltransferase family protein  32.71 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.863904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1658  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.56 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.324783  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1785  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  31.52 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.164455  normal  0.0571807 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0463  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.3 
 
 		 165 aa  43.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4148  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  29.73 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3660  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  35.11 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_850  phosphatidylglycerophosphate synthase  27.88 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490596  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  27.56 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4279  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.65 
 
 		 259 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2289  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.2 
 
 		 235 aa  42  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3037  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.91 
 
 		 299 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.174627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2943  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.91 
 
 		 299 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>