33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11800 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11800  histidine kinase  100 
 
 		 157 aa  309  9e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36370  histidine kinase  36.91 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3554  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4997  putative signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3463  ATP-binding region ATPase domain protein  36.36 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.218355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1303  hypothetical protein  43.82 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0850702  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0081  putative signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1572  putative signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.08 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.25 
 
 		 251 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2379  putative serine/threonine kinaseanti-sigma factor  33.59 
 
 		 197 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.084958 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  34.48 
 
 		 716 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  33.73 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  35.16 
 
 		 746 aa  44.7  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  39.24 
 
 		 470 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  34.38 
 
 		 1225 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 745 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0066  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  32.22 
 
 		 771 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 713 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  36.71 
 
 		 281 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2553  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.63 
 
 		 324 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3607  hypothetical protein  29.73 
 
 		 159 aa  42  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2813  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 590 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2643  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.55 
 
 		 688 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000425716  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  36.25 
 
 		 693 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  37.35 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  32.58 
 
 		 855 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1542  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 		 355 aa  40.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0477003  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1514  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.93 
 
 		 127 aa  40.4  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0502369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>