24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1303 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1303  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  284  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0850702  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4997  putative signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0081  putative signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1572  putative signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 		 161 aa  84  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3463  ATP-binding region ATPase domain protein  37.29 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.218355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36370  histidine kinase  37.31 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3554  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.21 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11800  histidine kinase  44.71 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  36.36 
 
 		 282 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  35.4 
 
 		 1225 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  33.62 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3607  hypothetical protein  35.79 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8468  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.71 
 
 		 245 aa  43.5  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 180 aa  43.5  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2553  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.66 
 
 		 324 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3724  ATPase domain-containing protein  33.85 
 
 		 163 aa  42.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  36.25 
 
 		 693 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2284  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.65 
 
 		 323 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0993778  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  41.82 
 
 		 1432 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3955  ATP-binding region ATPase domain protein  34.55 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  35 
 
 		 771 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  33.75 
 
 		 745 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  29.82 
 
 		 855 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>