25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36370 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36370  histidine kinase  100 
 
 		 157 aa  314  3e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3463  ATP-binding region ATPase domain protein  35.88 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.218355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11800  histidine kinase  36.91 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.243176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3554  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.43 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4997  putative signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1303  hypothetical protein  37.31 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0850702  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1572  putative signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0081  putative signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.1 
 
 		 738 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  41.05 
 
 		 1225 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.24 
 
 		 728 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  31.5 
 
 		 855 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3148  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00947281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.75 
 
 		 549 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  36.46 
 
 		 282 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.95 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3955  ATP-binding region ATPase domain protein  32.74 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.72 
 
 		 180 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.18 
 
 		 251 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  35.48 
 
 		 281 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  32.18 
 
 		 722 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  33.33 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 		 135 aa  40.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>