49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3546 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  93.35 
 
 		 346 aa  675    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  97.98 
 
 		 346 aa  705    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  99.42 
 
 		 346 aa  714    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  718    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  86.71 
 
 		 346 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  86.71 
 
 		 346 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  86.71 
 
 		 346 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  86.42 
 
 		 346 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  82.66 
 
 		 346 aa  594  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  68.99 
 
 		 349 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  68.5 
 
 		 346 aa  504  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  67.63 
 
 		 350 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  68.01 
 
 		 351 aa  499  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  66.47 
 
 		 350 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  64.64 
 
 		 351 aa  484  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  49.86 
 
 		 358 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  47.81 
 
 		 362 aa  353  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  49.29 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  50.29 
 
 		 348 aa  332  7.000000000000001e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  48.54 
 
 		 348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00208  glycosyl transferase  48.22 
 
 		 349 aa  317  3e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2984  hypothetical protein  46.33 
 
 		 354 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  42.35 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  40.88 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  40.18 
 
 		 347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  40.94 
 
 		 345 aa  272  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  40.52 
 
 		 347 aa  272  7e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  39.65 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  39.88 
 
 		 343 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  39.41 
 
 		 343 aa  258  9e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  40.52 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  32.72 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  34.15 
 
 		 328 aa  155  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  28.97 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  28.35 
 
 		 377 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  27.47 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  27.47 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  29.17 
 
 		 355 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  27.11 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  25.38 
 
 		 360 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  23.72 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  25.6 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  25.24 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  25.82 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  26.33 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  26.09 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  26.37 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2159  glycosyltransferase family 28 protein  24.53 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5685  Glycosyl transferase-like protein UDP- glucuronosyltransferase  22.25 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>