24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4350 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4350  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  1061    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.278598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3225  hypothetical protein  32.77 
 
 		 485 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1793  hypothetical protein  31.9 
 
 		 396 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2090  hypothetical protein  28.93 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.637771  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4859  hypothetical protein  28.53 
 
 		 549 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000408523  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2822  hypothetical protein  24.9 
 
 		 449 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.816333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1803  hypothetical protein  25.74 
 
 		 454 aa  107  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2345  hypothetical protein  26.52 
 
 		 416 aa  90.5  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0135  hypothetical protein  26.32 
 
 		 417 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6933  hypothetical protein  26.16 
 
 		 403 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1587  hypothetical protein  24.48 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191051  normal  0.665327 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0945  hypothetical protein  35.54 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523813  n/a   
 
 
 
NC_009636  Smed_1232  hypothetical protein  23.08 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.583385  normal  0.276368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1541  hypothetical protein  26.87 
 
 		 415 aa  67  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.615307 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0094  hypothetical protein  25.08 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2084  hypothetical protein  30.87 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0757382  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_50  hypothetical protein  42.17 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00190835  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0550  hypothetical protein  23.38 
 
 		 415 aa  54.3  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2294  hypothetical protein  22.05 
 
 		 415 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2331  hypothetical protein  31.76 
 
 		 423 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.122664  hitchhiker  0.0000000213226 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0752  hypothetical protein  34.94 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194226 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1775  hypothetical protein  23.19 
 
 		 453 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2217  hypothetical protein  29.19 
 
 		 304 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.529623  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0553  hypothetical protein  22.42 
 
 		 432 aa  43.9  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.844631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>