30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3805 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  570  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  90.81 
 
 
272 aa  524  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  82.93 
 
 
287 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  80.22 
 
 
277 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3608  hypothetical protein  91.39 
 
 
221 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  62.2 
 
 
260 aa  318  6e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  55.76 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  54.04 
 
 
323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  55.04 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  58.2 
 
 
272 aa  309  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  63.11 
 
 
251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  66.67 
 
 
255 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  63.23 
 
 
236 aa  295  6e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  61.43 
 
 
213 aa  277  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  60 
 
 
229 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2241  hypothetical protein  59.42 
 
 
223 aa  271  9e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0273  hypothetical protein  53.6 
 
 
231 aa  226  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1657  hypothetical protein  38.31 
 
 
211 aa  165  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1501  hypothetical protein  34.2 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0508793  hitchhiker  0.000844236 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  26.46 
 
 
524 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  26.26 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  24 
 
 
240 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  26.67 
 
 
442 aa  56.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0044  hypothetical protein  23.12 
 
 
227 aa  52.8  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  22.28 
 
 
476 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2182  hypothetical protein  25.24 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.942905  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0557  hypothetical protein  28 
 
 
240 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3924  hypothetical protein  31.63 
 
 
233 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349522  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2687  hypothetical protein  26.25 
 
 
208 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0274676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3991  hypothetical protein  22.28 
 
 
199 aa  42.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375654  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>