79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2326 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  56.7 
 
 		 293 aa  351  7e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0722  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  51.5 
 
 		 304 aa  316  3e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.669338  hitchhiker  0.0000193421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  48.16 
 
 		 298 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  50.97 
 
 		 299 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  54.3 
 
 		 255 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4235  beta-lactamase-like protein  49.23 
 
 		 257 aa  271  9e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0420  beta-lactamase fold protein  50.2 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00386164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  47.71 
 
 		 299 aa  255  7e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0050  hypothetical protein  49.8 
 
 		 259 aa  254  9e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  47.66 
 
 		 258 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  38.76 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  38.76 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  38.17 
 
 		 252 aa  182  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  40.86 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2477  exported protein  36.19 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  37.26 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 		 255 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  27.52 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  23.47 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  21.93 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  25.64 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  24.14 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0291  beta-lactamase domain protein  27.45 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0760  beta-lactamase domain protein  27.05 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2782  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.56 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.674441  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  23 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0065  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.9 
 
 		 264 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  22.34 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3716  metal-dependent hydrolase  26.96 
 
 		 230 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  25.12 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1524  beta-lactamase domain-containing protein  25.69 
 
 		 285 aa  52.8  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  24.68 
 
 		 258 aa  52.8  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  23.88 
 
 		 282 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0315  metal-dependent hydrolase  22.4 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00468893  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  26.05 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0635  metal-dependent hydrolase  23.02 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000707665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4333  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 		 241 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  24 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  22.84 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4324  beta-lactamase-like  24.39 
 
 		 273 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1075  beta-lactamase domain protein  24.53 
 
 		 227 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0220029  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.83 
 
 		 590 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9016  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  21.61 
 
 		 259 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  0.212694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0944  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  28.57 
 
 		 277 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4213  beta-lactamase domain protein  26.96 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  23.25 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3467  beta-lactamase domain protein  23.53 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.407477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2220  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 		 225 aa  47.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  25.12 
 
 		 219 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  23.21 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0300  metal-dependent hydrolase  27.75 
 
 		 225 aa  47  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  26.83 
 
 		 228 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  22.48 
 
 		 357 aa  46.6  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3437  beta-lactamase-like  25.52 
 
 		 233 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2032  beta-lactamase domain protein  26.24 
 
 		 226 aa  46.6  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.60548 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1653  metal-dependent hydrolase  23.69 
 
 		 226 aa  46.2  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.348192  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  22.84 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1196  beta-lactamase domain protein  24.11 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  21.16 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1476  beta-lactamase domain protein  25.85 
 
 		 226 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259193 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1482  hypothetical protein  20.69 
 
 		 201 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1068  Beta-lactamase-like  24.4 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1154  hypothetical protein  20.9 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1520  hypothetical protein  22.39 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2802  beta-lactamase domain-containing protein  31.63 
 
 		 352 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.502441  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  23.08 
 
 		 335 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.3 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3945  beta-lactamase domain-containing protein  24.52 
 
 		 244 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.24739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4343  beta-lactamase domain-containing protein  22.13 
 
 		 236 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585725  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  22.01 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5695  metal-dependent hydrolase  21.76 
 
 		 291 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2663  Zn-dependent hydrolase  19.05 
 
 		 351 aa  43.5  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.38 
 
 		 335 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1063  beta-lactamase domain protein  22.08 
 
 		 218 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1127  beta-lactamase domain protein  23.11 
 
 		 274 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.852965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2646  hypothetical protein  22.22 
 
 		 335 aa  42.7  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0567  hypothetical protein  32.93 
 
 		 284 aa  42.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0190057  hitchhiker  0.00000419669 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  21.75 
 
 		 307 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>