21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3372 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3372  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000516868  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03608  hypothetical protein  28.72 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2747  hypothetical protein  29.53 
 
 
275 aa  92.4  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3073  hypothetical protein  26.79 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00754966  normal  0.187539 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1009  hypothetical protein  25.19 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2333  hypothetical protein  24.15 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.0456221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2017  hypothetical protein  22.82 
 
 
315 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.02732 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3714  hypothetical protein  24.7 
 
 
295 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2026  hypothetical protein  19.06 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.958277  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3855  hypothetical protein  25.16 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3092  hypothetical protein  21.57 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0671973  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2463  hypothetical protein  20.36 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0110  hypothetical protein  21.51 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2824  hypothetical protein  25.81 
 
 
260 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.266593  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  24.89 
 
 
285 aa  47  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1726  hypothetical protein  29.19 
 
 
305 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00978889 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4416  hypothetical protein  29.19 
 
 
305 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003214  hypothetical protein  21.4 
 
 
271 aa  45.8  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5707  hypothetical protein  22.58 
 
 
247 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.045893  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1445  hypothetical protein  46.81 
 
 
320 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352294  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  26.9 
 
 
314 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>