More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2889 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2889  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  100 
 
 
474 aa  966    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1329  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  81.7 
 
 
472 aa  766    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117788  decreased coverage  0.000167775 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0769  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  62.66 
 
 
475 aa  580  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.934178  normal  0.109685 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00703  phosphomannomutase  59.57 
 
 
472 aa  565  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2309  putative phosphomannomutase  60 
 
 
477 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0454655 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2422  putative phosphomannomutase  59.79 
 
 
477 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2311  putative phosphomannomutase  59.57 
 
 
477 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2208  putative phosphomannomutase  59.79 
 
 
477 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11518  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2262  phosphomannomutase  57.82 
 
 
478 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033572 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1902  Phosphomannomutase  49.57 
 
 
473 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1733  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  49.46 
 
 
469 aa  429  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000017319  normal  0.274178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3809  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  46.72 
 
 
517 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3790  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.35 
 
 
510 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4824  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.8 
 
 
499 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921542  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3231  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.78 
 
 
490 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0401358  normal  0.764695 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1061  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.69 
 
 
484 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.799252  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0943  phosphomannomutase, putative  43.69 
 
 
483 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774465  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.68 
 
 
474 aa  359  7e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431398  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2993  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.11 
 
 
474 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3242  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.11 
 
 
474 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0348  phosphoglucomutase, putative  43.22 
 
 
477 aa  344  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.896466  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0126  phosphomannomutase  43.19 
 
 
481 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0540  putative phosphomannomutase  41.9 
 
 
467 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4097  hypothetical protein  44.97 
 
 
466 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.909897  normal  0.207612 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1234  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.78 
 
 
469 aa  316  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.565449  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  40.04 
 
 
1553 aa  315  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0537  phosphomannomutase, putative  41.27 
 
 
445 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4052  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  43.01 
 
 
469 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  42.79 
 
 
499 aa  309  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4216  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.37 
 
 
465 aa  296  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  27.44 
 
 
450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  27.2 
 
 
448 aa  111  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  27.62 
 
 
449 aa  110  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  28.15 
 
 
459 aa  107  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  27.43 
 
 
450 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  26.38 
 
 
460 aa  104  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  27.16 
 
 
454 aa  103  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  27.61 
 
 
451 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  27.61 
 
 
451 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  27.41 
 
 
451 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  29.67 
 
 
454 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2013  phosphoglucosamine mutase  28.77 
 
 
443 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.993566  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  28.99 
 
 
483 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  28.72 
 
 
448 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  25 
 
 
449 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  25.63 
 
 
450 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  26.5 
 
 
446 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  24.79 
 
 
458 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  25.89 
 
 
450 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  24.5 
 
 
433 aa  100  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0667  hypothetical protein  25.22 
 
 
419 aa  100  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  27.02 
 
 
446 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  26.63 
 
 
452 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  27.02 
 
 
446 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2638  phosphoglucosamine mutase  25.86 
 
 
448 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2324  phosphoglucosamine mutase  25.86 
 
 
448 aa  99.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  25.22 
 
 
453 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  28.21 
 
 
469 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  25.91 
 
 
447 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  26.65 
 
 
450 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  26.21 
 
 
466 aa  97.8  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  26.47 
 
 
453 aa  97.8  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  23.48 
 
 
452 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  29.28 
 
 
450 aa  97.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1664  phosphoglucosamine mutase  28.93 
 
 
444 aa  97.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.194728 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  27.96 
 
 
449 aa  97.4  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  26.42 
 
 
434 aa  97.1  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  30.92 
 
 
453 aa  97.1  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2668  Phosphoglucosamine mutase  25.47 
 
 
478 aa  97.1  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000530484  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  26.44 
 
 
430 aa  96.7  8e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  26.22 
 
 
430 aa  96.3  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  25.41 
 
 
454 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  23.59 
 
 
458 aa  96.3  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  24.89 
 
 
480 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  26.14 
 
 
449 aa  96.3  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  25.31 
 
 
445 aa  96.3  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  27.72 
 
 
447 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  27.47 
 
 
455 aa  96.3  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  28.89 
 
 
447 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  25.37 
 
 
446 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  28.99 
 
 
449 aa  95.9  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  25.86 
 
 
451 aa  95.5  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  29.3 
 
 
448 aa  95.9  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0636  phosphoglucosamine mutase  29.92 
 
 
445 aa  95.9  2e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.605562  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  25.36 
 
 
451 aa  95.5  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  27.53 
 
 
445 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  26.83 
 
 
449 aa  94.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  29.08 
 
 
450 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  25.05 
 
 
448 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0209  phosphoglucosamine mutase  27.43 
 
 
460 aa  94  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  26.25 
 
 
459 aa  94  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  25.42 
 
 
446 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1807  phosphoglucosamine mutase  27.94 
 
 
446 aa  93.6  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0742  phosphoglucosamine mutase  26.43 
 
 
446 aa  93.6  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  24.95 
 
 
448 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  26.11 
 
 
451 aa  93.6  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  26.78 
 
 
454 aa  93.6  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  28.73 
 
 
446 aa  93.6  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  27.76 
 
 
447 aa  93.2  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  24.84 
 
 
448 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>