More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1329 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2889  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  81.7 
 
 		 474 aa  791    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1329  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  100 
 
 		 472 aa  958    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117788  decreased coverage  0.000167775 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00703  phosphomannomutase  61.42 
 
 		 472 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0769  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  62.77 
 
 		 475 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.934178  normal  0.109685 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2262  phosphomannomutase  59.1 
 
 		 478 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2208  putative phosphomannomutase  60.6 
 
 		 477 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11518  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2422  putative phosphomannomutase  60.6 
 
 		 477 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2311  putative phosphomannomutase  60.39 
 
 		 477 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2309  putative phosphomannomutase  60.81 
 
 		 477 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0454655 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1902  Phosphomannomutase  49.68 
 
 		 473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1733  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  50.65 
 
 		 469 aa  436  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000017319  normal  0.274178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3809  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  46.8 
 
 		 517 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4824  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  46.43 
 
 		 499 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921542  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3790  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.79 
 
 		 510 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0943  phosphomannomutase, putative  46.32 
 
 		 483 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774465  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1061  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  46.32 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.799252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3231  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  44.89 
 
 		 490 aa  381  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0401358  normal  0.764695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2993  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  44.84 
 
 		 474 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.26 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431398  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3242  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  44.73 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0348  phosphoglucomutase, putative  44.8 
 
 		 477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.896466  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0540  putative phosphomannomutase  42.83 
 
 		 467 aa  355  8.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0126  phosphomannomutase  44.37 
 
 		 481 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0537  phosphomannomutase, putative  42.26 
 
 		 445 aa  333  5e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1234  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.43 
 
 		 469 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.565449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4052  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  44.69 
 
 		 469 aa  316  5e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.23 
 
 		 499 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  38.46 
 
 		 1553 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4097  hypothetical protein  46.17 
 
 		 466 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.909897  normal  0.207612 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4216  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.74 
 
 		 465 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  26.38 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  27.5 
 
 		 459 aa  121  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  27.14 
 
 		 483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  26.46 
 
 		 451 aa  120  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  26.46 
 
 		 451 aa  120  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  27.54 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  28.51 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2839  phosphoglucosamine mutase  28.33 
 
 		 453 aa  110  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  25.71 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  26.05 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  28.28 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  25.42 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  25.42 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  25.62 
 
 		 450 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  25.21 
 
 		 448 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  25.42 
 
 		 448 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2013  phosphoglucosamine mutase  28.65 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.993566  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  25.49 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  25.46 
 
 		 450 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  25.21 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  25.21 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  25.21 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  25.21 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  25.21 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  25.21 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  27.72 
 
 		 454 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  26.01 
 
 		 455 aa  107  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2223  phosphoglucosamine mutase  28.19 
 
 		 441 aa  107  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.810358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  27.94 
 
 		 447 aa  106  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  28.35 
 
 		 450 aa  106  9e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  26.82 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  27.17 
 
 		 454 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  24 
 
 		 433 aa  106  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1664  phosphoglucosamine mutase  26.6 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.194728 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  28.76 
 
 		 465 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  25.21 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  28.24 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  26.48 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  25.2 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  27.78 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  25 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  26.92 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  26.92 
 
 		 446 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  26.38 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2381  phosphoglucosamine mutase  26.91 
 
 		 444 aa  104  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  24.84 
 
 		 448 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0242  phosphoglucosamine mutase  24.63 
 
 		 442 aa  104  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1477  phosphoglucosamine mutase  26.91 
 
 		 444 aa  103  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  28.53 
 
 		 449 aa  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  25.42 
 
 		 460 aa  103  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0282  Phosphoglucosamine mutase  25.8 
 
 		 416 aa  103  7e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  26.04 
 
 		 451 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  25.95 
 
 		 451 aa  103  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  25.53 
 
 		 449 aa  103  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  29.22 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  26.16 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2619  phosphoglucosamine mutase  26.54 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317995  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3449  phosphoglucosamine mutase  26.43 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  29.46 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  26.29 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  27.68 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  26.5 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  24.68 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  25.43 
 
 		 446 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2850  phosphoglucosamine mutase  26.65 
 
 		 443 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  30.29 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  29.35 
 
 		 447 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  24.38 
 
 		 448 aa  100  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  26.67 
 
 		 452 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  25.71 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>