More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3231 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3231  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  100 
 
 
490 aa  981    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0401358  normal  0.764695 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4824  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  59.84 
 
 
499 aa  526  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921542  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3790  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  56.33 
 
 
510 aa  495  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0943  phosphomannomutase, putative  54.47 
 
 
483 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774465  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1061  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  54.47 
 
 
484 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.799252  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1902  Phosphomannomutase  51.67 
 
 
473 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1733  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  52.07 
 
 
469 aa  436  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000017319  normal  0.274178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3809  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  47.97 
 
 
517 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.33 
 
 
474 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431398  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0769  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.85 
 
 
475 aa  388  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.934178  normal  0.109685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2889  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.78 
 
 
474 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1329  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.89 
 
 
472 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117788  decreased coverage  0.000167775 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0540  putative phosphomannomutase  44.89 
 
 
467 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0348  phosphoglucomutase, putative  44.1 
 
 
477 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.896466  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00703  phosphomannomutase  43.48 
 
 
472 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2262  phosphomannomutase  43.06 
 
 
478 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033572 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2422  putative phosphomannomutase  43.89 
 
 
477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2208  putative phosphomannomutase  43.89 
 
 
477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11518  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2309  putative phosphomannomutase  43.89 
 
 
477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0454655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2311  putative phosphomannomutase  43.89 
 
 
477 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2993  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  44.44 
 
 
474 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0537  phosphomannomutase, putative  44.2 
 
 
445 aa  354  2.9999999999999997e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0126  phosphomannomutase  44.02 
 
 
481 aa  344  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3242  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.98 
 
 
474 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1234  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.59 
 
 
469 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.565449  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  42.16 
 
 
1553 aa  333  5e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4216  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.38 
 
 
465 aa  313  6.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  39.24 
 
 
499 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4052  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  47.13 
 
 
469 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4097  hypothetical protein  46.74 
 
 
466 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.909897  normal  0.207612 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  24.2 
 
 
449 aa  109  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  27.79 
 
 
460 aa  103  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  25.81 
 
 
458 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  24.9 
 
 
453 aa  91.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  25.05 
 
 
450 aa  90.5  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  25.15 
 
 
452 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  24.9 
 
 
430 aa  87.8  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  28.48 
 
 
458 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  26.27 
 
 
430 aa  87  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  23.17 
 
 
449 aa  87  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  26.2 
 
 
418 aa  86.7  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0187  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  25.25 
 
 
439 aa  86.7  9e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.117639  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  25.2 
 
 
448 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  27.83 
 
 
480 aa  85.9  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0512  Phosphoglucosamine mutase  28.27 
 
 
460 aa  85.5  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  24.74 
 
 
430 aa  85.1  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  29.25 
 
 
496 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  29.25 
 
 
496 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  26.56 
 
 
454 aa  83.2  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29340  phosphoglucosamine mutase  28.1 
 
 
452 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313893  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0667  hypothetical protein  23.68 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  25.96 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  29.76 
 
 
482 aa  80.5  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0282  Phosphoglucosamine mutase  24.69 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  25.69 
 
 
459 aa  80.1  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  27.52 
 
 
455 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  23.53 
 
 
475 aa  79  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1582  phosphoglucosamine mutase  25.47 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0060705  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0512  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  25.4 
 
 
447 aa  77.8  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  24.8 
 
 
475 aa  76.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0764  phosphoglucosamine mutase  24.48 
 
 
427 aa  77  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.882404  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  24.71 
 
 
475 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0740  phosphoglucosamine mutase  24.38 
 
 
429 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  24.07 
 
 
455 aa  75.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  26.9 
 
 
469 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1578  phosphoglucosamine mutase  25.74 
 
 
436 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.840977  normal  0.129452 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1688  phosphoglucosamine mutase  26.49 
 
 
465 aa  75.5  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0304007  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02741  phosphotransferase superclass  21.74 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.531675  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0243  phosphoglucosamine mutase  20.87 
 
 
450 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.439352  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0223  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  24.65 
 
 
452 aa  74.7  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00762456  normal  0.0119193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1785  Phosphomannomutase  26.44 
 
 
458 aa  73.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  25.05 
 
 
460 aa  73.9  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0400  phosphoglucosamine mutase  25.31 
 
 
446 aa  73.6  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2027  phosphoglucosamine mutase  26.15 
 
 
447 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0191  phosphoglucosamine mutase  24.28 
 
 
453 aa  72  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.13045  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  24.35 
 
 
455 aa  72.4  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1248  phosphoglucosamine mutase  23.37 
 
 
447 aa  71.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0891  phosphoglucosamine mutase  26.7 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  24.02 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2324  phosphoglucosamine mutase  24.37 
 
 
448 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  25.36 
 
 
447 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  26.79 
 
 
475 aa  70.5  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2638  phosphoglucosamine mutase  24.37 
 
 
448 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  22.95 
 
 
451 aa  70.5  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0315  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  24.49 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.660935 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1019  phosphoglucosamine mutase  23.36 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0586  phosphoglucosamine mutase  23.16 
 
 
453 aa  70.5  0.00000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1384  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  26.15 
 
 
454 aa  70.1  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  25 
 
 
454 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  25.24 
 
 
454 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02641  phosphotransferase superclass  21.11 
 
 
450 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.23702  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2740  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.05 
 
 
445 aa  69.7  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0255  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  27.46 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  28.37 
 
 
449 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0375  phosphoglucosamine mutase  24.17 
 
 
448 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  25 
 
 
451 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0717  phosphoglucosamine mutase  23.91 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  25.36 
 
 
465 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2822  phosphoglucosamine mutase  24.18 
 
 
450 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1127  Phosphoglucosamine mutase  25.55 
 
 
451 aa  68.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.402021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>