More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26800 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_26800  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  100 
 
 		 413 aa  834    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2272  SufBD protein  52.31 
 
 		 481 aa  295  8e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12900  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  34.89 
 
 		 435 aa  205  9e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0400  SufBD protein  31.63 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.524622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0654  SufBD protein  29.58 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2330  SufBD protein  30.21 
 
 		 349 aa  96.3  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1638  SufBD protein  26.21 
 
 		 350 aa  90.9  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.822468  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0267  SufBD protein  25.79 
 
 		 375 aa  90.1  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1140  SufBD protein  26.9 
 
 		 373 aa  86.3  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0049  SufBD protein  25.13 
 
 		 372 aa  82.8  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0472  FeS assembly protein SufD  29.88 
 
 		 450 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.337092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5393  FeS assembly protein SufD  32.54 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  27.35 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0892  FeS assembly protein SufD  37.07 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1206  FeS assembly protein SufB  28.49 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0384919  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0174  SufBD protein  24.2 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0142  hypothetical protein  26.99 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1697  FeS assembly protein SufD  27.56 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1502  SufBD protein  24.24 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0987  SufBD protein  29.38 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.137837  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2920  SufBD protein  24.49 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.689124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  25.51 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1005  FeS assembly protein SufD  26.18 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.868893 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0412  FeS assembly protein SufD  23.04 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2922  FeS assembly protein SufD  26.24 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5122  FeS assembly protein SufD  27.5 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.273896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5119  hypothetical protein  27.5 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4850  hypothetical protein  27 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4691  iron-regulated ABC transporter  27 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4804  FeS assembly protein SufD  27 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5216  hypothetical protein  27 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0219  hypothetical protein  35.24 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0116  FeS assembly protein SufD  27 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4706  iron-regulated ABC transporter  27 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5124  FeS assembly protein SufD  27 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.233215  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  23.11 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0668  FeS assembly protein SufD  24.06 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5087  FeS assembly protein SufD  27 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  27.18 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1973  hypothetical protein  30.06 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  25.26 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1113  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  25.37 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.185623  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2430  SufBD protein  22.87 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0860  FeS assembly protein SufD  23.42 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  34.91 
 
 		 499 aa  67.8  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0844  FeS assembly protein SufD  23.42 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0959  FeS assembly protein SufD  22.36 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  23.42 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3578  FeS assembly protein SufD  27.33 
 
 		 430 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  34.91 
 
 		 552 aa  66.6  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0497  FeS assembly protein SufD  25 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  25.13 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0378  SufBD protein  26.92 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0643358  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  22.52 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3073  FeS assembly protein SufD  25.79 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1840  FeS assembly protein SufB  23.04 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  33.33 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  22.87 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2037  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  33.33 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  24.78 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  23.77 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  26.46 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  22.97 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  29.69 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  28.03 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  30.14 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  23.42 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  22.97 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  24.62 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03041  ABC transporter, membrane component  33.64 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  28.96 
 
 		 467 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1661  FeS assembly protein SufD  24.24 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.249285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  24.73 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  33.55 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0816  ABC transporter membrane protein  28.95 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  24.19 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  28.95 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1078  FeS assembly protein SufB  22.4 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000122877  normal  0.697067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11489  hypothetical protein  24.62 
 
 		 846 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000249036  normal  0.700584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  23.08 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  33.61 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  24.1 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  22.82 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  18.89 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  32.77 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  23.59 
 
 		 485 aa  59.7  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2358  SufBD  30 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0305  FeS assembly protein SufD  24.35 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4355  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  30.17 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.365891  normal  0.971222 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  24.78 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  28.46 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  22.56 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  27.55 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  25.9 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  31.19 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  25.13 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  23.59 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  24.34 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0404  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  35.29 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>