45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21820 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21820  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.137543 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11260  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase  73.45 
 
 		 236 aa  341  5e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1680  hypothetical protein  57.46 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0799939  normal  0.0725804 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1927  formate dehydrogenase, putative  26.48 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.58806  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0709  formate dehydrogenase gamma subunit  26.46 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619237 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3252  formate dehydrogenase gamma subunit  26.46 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3922  formate dehydrogenase, putative  25.56 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4269  formate dehydrogenase, gamma subunit  28.51 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.308563  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1816  formate dehydrogenase gamma subunit  28.04 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.621402  normal  0.0631982 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3488  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.35 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2551  formate dehydrogenase gamma subunit  25.23 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233004  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4811  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.11 
 
 		 337 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3722  formate dehydrogenase gamma subunit  25.33 
 
 		 342 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.973901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3793  formate dehydrogenase gamma subunit  25.33 
 
 		 342 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3918  formate dehydrogenase gamma subunit  25.33 
 
 		 342 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.524619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4108  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.33 
 
 		 342 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0231  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.33 
 
 		 342 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.148451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4138  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.33 
 
 		 342 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4226  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.33 
 
 		 342 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278212 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2087  hypothetical protein  24.06 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000659531  hitchhiker  0.0000000000148039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3089  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.82 
 
 		 339 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.971342  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6558  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.31 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892588  hitchhiker  0.000719745 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4511  formate dehydrogenase, C subunit, putative  24.45 
 
 		 342 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0086  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.67 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0061  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.12 
 
 		 335 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3263  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.24 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.688526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0870  formate dehydrogenase gamma subunit  25.24 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2660  formate dehydrogenase-N subunit gamma  23.79 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.485157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2451  formate dehydrogenase gamma subunit  23.87 
 
 		 339 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0779662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0335  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.02 
 
 		 342 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08530  Ni,Fe-hydrogenase I cytochrome b subunit  27.75 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.360929 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4520  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.61 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1333  formate dehydrogenase-N subunit gamma  23.79 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1208  formate dehydrogenase, gamma subunit, putative  23.11 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2640  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.85 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.174669 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0059  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.17 
 
 		 338 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1573  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.85 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0259  hypothetical protein  26.01 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0797  formate dehydrogenase gamma subunit  24.56 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205396  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1429  formate dehydrogenase-O subunit gamma  24.67 
 
 		 211 aa  42  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5489  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.08 
 
 		 341 aa  42.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0440  formate dehydrogenase, gamma subunit  21.88 
 
 		 214 aa  42  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4214  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.77 
 
 		 321 aa  42.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1284  formate dehydrogenase-N subunit gamma  24.3 
 
 		 211 aa  42  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.43156  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0506  formate dehydrogenase, gamma subunit  25 
 
 		 342 aa  42  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.579311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>