46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20940 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_20940  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  100 
 
 
209 aa  416  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00200  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  59.42 
 
 
210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.322798 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24900  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  60.87 
 
 
207 aa  207  7e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.910504  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0622  Formiminotransferase-cyclodeaminase  45.85 
 
 
217 aa  177  8e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.402773  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0556  Formiminotransferase-cyclodeaminase  42.08 
 
 
212 aa  168  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0698  Formiminotransferase-cyclodeaminase  34.62 
 
 
217 aa  131  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2862  Formiminotransferase-cyclodeaminase  40.2 
 
 
203 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0428  Formiminotransferase-cyclodeaminase  31.9 
 
 
212 aa  121  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4470  formiminotransferase-cyclodeaminase  37.37 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0694  glutamate formiminotransferase  36.31 
 
 
518 aa  112  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1135  glutamate formiminotransferase  30.43 
 
 
555 aa  112  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000259237  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1415  formiminotransferase-cyclodeaminase  31.61 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000124599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0400  formiminotransferase-cyclodeaminase  33.66 
 
 
212 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3258  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  38.92 
 
 
210 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0913  Formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  34.39 
 
 
210 aa  105  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0325  hypothetical protein  33.52 
 
 
209 aa  104  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3495  Formiminotransferase-cyclodeaminase  27.54 
 
 
211 aa  99  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501957  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1798  formiminotransferase-cyclodeaminase  37.93 
 
 
208 aa  97.8  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2134  Formiminotransferase-cyclodeaminase  40.54 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1277  Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  35.14 
 
 
210 aa  95.5  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.490146  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0059  Formiminotransferase-cyclodeaminase  34.04 
 
 
212 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.279753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6555  formiminotransferase-cyclodeaminase  39.78 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911075  normal  0.092837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1750  Formiminotransferase-cyclodeaminase  37.62 
 
 
220 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3667  formiminotransferase-cyclodeaminase  38.36 
 
 
213 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.245003  normal  0.363416 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2588  Formiminotransferase-cyclodeaminase  27.84 
 
 
210 aa  91.3  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169929  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0507  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  38.42 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1031  formiminotransferase-cyclodeaminase  33.16 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7115  Formiminotransferase-cyclodeaminase  38.67 
 
 
207 aa  89  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712261  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0046  formiminotransferase-cyclodeaminase family protein  26.67 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1232  formiminotransferase-cyclodeaminase  32.54 
 
 
202 aa  88.2  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1223  formiminotransferase-cyclodeaminase  32.54 
 
 
202 aa  88.2  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1074  formiminotransferase-cyclodeaminase  30.98 
 
 
209 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00274886  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0902  formiminotransferase-cyclodeaminase  28.74 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136254  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2569  Formiminotransferase-cyclodeaminase  27.43 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.804343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4575  formiminotransferase-cyclodeaminase  31.25 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0122  formiminotransferase-cyclodeaminase  39.18 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1837  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  27.45 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0022592  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2123  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  27.45 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0263  glutamate formiminotransferase  29.58 
 
 
495 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0569087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5039  Formiminotransferase-cyclodeaminase  36.42 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402741  normal  0.343304 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1023  formiminotransferase-cyclodeaminase  30.12 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.866401  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0347  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  31.25 
 
 
206 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2878  Formiminotransferase-cyclodeaminase  30.6 
 
 
206 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210115  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0398  Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase-like protein  20.11 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3464  Formiminotransferase-cyclodeaminase  28.35 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4182  formiminotransferase-cyclodeaminase  32.9 
 
 
268 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.311469  normal  0.618001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>