98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13100 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_13100  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  100 
 
 
293 aa  609  1e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0309972  normal  0.551391 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15620  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  41.3 
 
 
300 aa  241  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0266793  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2256  Patatin  41.53 
 
 
295 aa  219  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  31.82 
 
 
284 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  31.82 
 
 
284 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  31.82 
 
 
284 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  31.47 
 
 
284 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  31.47 
 
 
284 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  31.82 
 
 
284 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  31.82 
 
 
284 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  31.82 
 
 
284 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  31.82 
 
 
284 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  31.82 
 
 
284 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  31.47 
 
 
284 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  30.61 
 
 
285 aa  139  7e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2735  patatin  31.51 
 
 
304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0568052  hitchhiker  0.0000690966 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  29.51 
 
 
282 aa  125  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1546  patatin family phospholipase  30.39 
 
 
279 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00664201  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1339  patatin-like phospholipase family protein  30.39 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00020938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3733  patatin  30.07 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4525  hypothetical protein  29.72 
 
 
289 aa  119  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3931  patatin  29.72 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00834869  normal  0.974076 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  28.32 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0217  Patatin  30.69 
 
 
293 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000888537  normal  0.183812 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  33.11 
 
 
283 aa  117  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3804  patatin  29.02 
 
 
290 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0215  patatin  29.97 
 
 
293 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000161768  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4122  patatin  29.62 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00238218  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3501  patatin  29.72 
 
 
289 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0437866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4243  patatin  29.37 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  hitchhiker  0.00194419 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0543  alpha-beta hydrolase family esterase  29.93 
 
 
282 aa  109  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.47199e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  28 
 
 
283 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  27.64 
 
 
283 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  29.75 
 
 
289 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0103  putative esterase-like protein  28.36 
 
 
281 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  27.27 
 
 
283 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  28.36 
 
 
283 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  27.27 
 
 
283 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  27.27 
 
 
283 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  28.36 
 
 
283 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2059  hypothetical protein  28.72 
 
 
281 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  25.36 
 
 
270 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1792  Patatin  26.03 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  26.67 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06415  phospholipase  27.85 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0997  patatin  26.21 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00027457  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0214  patatin-like phospholipase  26.6 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000588  hypothetical protein  28.76 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.233579  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08930  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  25.87 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0254499  normal  0.882141 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1253  Patatin  25.41 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1897  Patatin  26.06 
 
 
290 aa  77  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184207  hitchhiker  0.00000000000000682914 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  25.43 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2812  patatin  28.5 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338159  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06662  hypothetical protein  27.66 
 
 
290 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001123  hypothetical protein  27.47 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0238457  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01883  hypothetical protein  26.67 
 
 
287 aa  62.4  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2356  patatin  27.32 
 
 
345 aa  56.6  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  26.98 
 
 
638 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  27.44 
 
 
332 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  27.18 
 
 
382 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  27.27 
 
 
387 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02679  Patatin  25.57 
 
 
378 aa  50.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1595  hypothetical protein  23.17 
 
 
389 aa  49.7  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2574  Patatin  24.76 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649252  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003010  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  26.02 
 
 
383 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0935  Patatin  24.64 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  27.36 
 
 
417 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02892  hypothetical protein  23.37 
 
 
381 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  27.27 
 
 
405 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  25.35 
 
 
429 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  24.89 
 
 
360 aa  46.2  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  23.11 
 
 
423 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0302  Patatin  34.07 
 
 
292 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21876  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4424  putative patatin-like phospholipase protein  34.07 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25006  normal  0.316813 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  26.32 
 
 
405 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2613  patatin  24.66 
 
 
415 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  26.32 
 
 
405 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  25.36 
 
 
405 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  25.36 
 
 
405 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2385  patatin  23.28 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000835704  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  25.36 
 
 
405 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  25.61 
 
 
379 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2550  patatin  22.62 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0028  patatin  32.97 
 
 
288 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0718  patatin  24.88 
 
 
344 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0491611  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  24.41 
 
 
442 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  27.05 
 
 
400 aa  43.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  26.07 
 
 
412 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  26.07 
 
 
412 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  26.07 
 
 
412 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  26.07 
 
 
412 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.19 
 
 
765 aa  43.1  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  26.07 
 
 
412 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  26.07 
 
 
412 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  24.14 
 
 
399 aa  42.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  26.07 
 
 
390 aa  42.7  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  22.64 
 
 
416 aa  42.7  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  26.07 
 
 
390 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>