More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4096 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_4096  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  313  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.461798  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  40.67 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  36.17 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  34.51 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  40.97 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  34.51 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  33.33 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  37.23 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  37.23 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  36.5 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  34.01 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  39.86 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  36.88 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0189  Thioredoxin domain  33.8 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  36.17 
 
 		 139 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000083  thioredoxin 2  34.51 
 
 		 144 aa  98.2  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.396729  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  38.97 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0335  thioredoxin domain-containing protein  36.84 
 
 		 150 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  35.66 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  34.53 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  34.04 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3446  thioredoxin family protein, selenocysteine-containing  33.57 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.238909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  42.57 
 
 		 107 aa  93.2  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  39.81 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0690  thioredoxin 2  31.47 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.555698  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  42.16 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0887  thioredoxin 2  33.57 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00834128  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  37.5 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05698  thioredoxin 2  31.47 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2633  thioredoxin 2  30.14 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0747279  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  33.33 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1543  Thioredoxin domain protein  33.82 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3392  thioredoxin  29.79 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  42.16 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  41.75 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  40.2 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0452  thioredoxin  30.77 
 
 		 140 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.531645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  40.2 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  31.91 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  31.91 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  31.91 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  31.91 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  31.91 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  31.91 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  31.91 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  31.91 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  31.91 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  38.24 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  33.59 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2401  thioredoxin  33.81 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.85345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  31.21 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  32.62 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  31.21 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3022  thioredoxin  41.49 
 
 		 108 aa  87.8  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  32.33 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  31.21 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3573  thioredoxin  30.77 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  31.21 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  31.21 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  37.5 
 
 		 108 aa  87  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0456  thioredoxin  30.07 
 
 		 140 aa  87  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  40.78 
 
 		 109 aa  87  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  32.58 
 
 		 140 aa  86.7  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  29.08 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  35.33 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  40.4 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  38.61 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  40.59 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  38.61 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  41.49 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  40.59 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  38.24 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  38.83 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  41.67 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  41.67 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  36.89 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  36.89 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3906  thioredoxin  29.37 
 
 		 170 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  36.79 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  36.89 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  40.86 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  39.22 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  33.33 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4029  thioredoxin  29.37 
 
 		 170 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  40.21 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  40.21 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0428  thioredoxin  29.37 
 
 		 170 aa  84.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  39.22 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  39.81 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  40.21 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  40.86 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0738  thioredoxin 2  32.59 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  38.61 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  43.82 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  39.78 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1670  thioredoxin  36.11 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  29.86 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  37.25 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>