More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2582 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02315  ATP synthase beta chain, mitochondrial (Eurofung)  66.38 
 
 		 518 aa  637    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.39 
 
 		 462 aa  680    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.53 
 
 		 462 aa  675    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.02 
 
 		 471 aa  709    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.37 
 
 		 470 aa  735    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  67.16 
 
 		 482 aa  649    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 		 476 aa  638    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.46 
 
 		 478 aa  637    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.3 
 
 		 484 aa  649    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.186879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.15 
 
 		 484 aa  652    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.66 
 
 		 468 aa  653    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.03 
 
 		 470 aa  726    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.83 
 
 		 472 aa  648    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.86 
 
 		 474 aa  660    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.43 
 
 		 521 aa  641    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0290  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.67 
 
 		 469 aa  639    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00322689  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0325  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.8 
 
 		 472 aa  650    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 		 469 aa  653    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 		 469 aa  653    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.88 
 
 		 462 aa  668    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 		 469 aa  653    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.59 
 
 		 484 aa  635    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  65.97 
 
 		 487 aa  655    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3366  ATP synthase F1, beta subunit  77.42 
 
 		 469 aa  718    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  67.16 
 
 		 547 aa  636    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.73 
 
 		 467 aa  642    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.58 
 
 		 474 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0106  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 		 464 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.23 
 
 		 471 aa  710    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.11 
 
 		 480 aa  646    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.38 
 
 		 468 aa  645    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.1 
 
 		 459 aa  652    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.72 
 
 		 476 aa  656    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.37 
 
 		 482 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.02 
 
 		 471 aa  743    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.17 
 
 		 517 aa  645    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 		 474 aa  650    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.38 
 
 		 465 aa  672    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.93 
 
 		 468 aa  716    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.93 
 
 		 468 aa  716    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3288  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.67 
 
 		 464 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.17 
 
 		 482 aa  678    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.07 
 
 		 474 aa  648    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.74 
 
 		 462 aa  671    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.52 
 
 		 470 aa  730    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.85 
 
 		 470 aa  730    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.23 
 
 		 469 aa  654    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 		 469 aa  653    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 		 493 aa  635    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.66 
 
 		 470 aa  747    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.45 
 
 		 471 aa  717    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.03 
 
 		 470 aa  723    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.25 
 
 		 474 aa  649    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.53 
 
 		 462 aa  674    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  75.8 
 
 		 468 aa  728    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.97 
 
 		 482 aa  677    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.76 
 
 		 481 aa  692    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.22 
 
 		 476 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.68 
 
 		 481 aa  667    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.46 
 
 		 467 aa  644    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4484  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.19 
 
 		 482 aa  680    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.66 
 
 		 468 aa  653    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0343  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.83 
 
 		 483 aa  635    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 		 476 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 475 aa  656    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.24 
 
 		 458 aa  637    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0218  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.57 
 
 		 482 aa  649    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.933064  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.38 
 
 		 469 aa  646    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.01 
 
 		 476 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.43 
 
 		 521 aa  641    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 		 476 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.17 
 
 		 462 aa  673    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.98 
 
 		 472 aa  667    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.23 
 
 		 464 aa  653    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.17 
 
 		 509 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4503  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.19 
 
 		 482 aa  680    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 		 513 aa  652    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.29 
 
 		 473 aa  731    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.43 
 
 		 472 aa  671    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.3 
 
 		 519 aa  645    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 		 465 aa  642    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 		 465 aa  640    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6635  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 484 aa  647    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.59 
 
 		 468 aa  647    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  67.8 
 
 		 530 aa  653    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 		 478 aa  650    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  68.39 
 
 		 467 aa  649    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54086  predicted protein  68.48 
 
 		 501 aa  654    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0980495  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 		 464 aa  645    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0171  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 		 476 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7380  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.6 
 
 		 484 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230144  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.26 
 
 		 475 aa  649    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  69.48 
 
 		 503 aa  645    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.01 
 
 		 475 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.53 
 
 		 537 aa  635    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.96 
 
 		 462 aa  673    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 		 473 aa  649    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.25 
 
 		 470 aa  725    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 469 aa  949    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.8 
 
 		 474 aa  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>