More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1087 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2859  aldehyde dehydrogenase  60.37 
 
 		 540 aa  659    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.209898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0818  aldehyde dehydrogenase family protein  64.35 
 
 		 541 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2271  Aldehyde Dehydrogenase  60.98 
 
 		 541 aa  684    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0315969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3443  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative  62.29 
 
 		 539 aa  683    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.381863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2493  aldehyde dehydrogenase  62.1 
 
 		 539 aa  679    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.442503 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4059  aldehyde dehydrogenase  63.04 
 
 		 542 aa  701    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.739878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2321  aldehyde dehydrogenase  62.48 
 
 		 539 aa  685    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3462  aldehyde dehydrogenase  63.04 
 
 		 542 aa  701    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27210  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  62.11 
 
 		 541 aa  683    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0162  aldehyde dehydrogenase  59.43 
 
 		 536 aa  651    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.396114  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5161  aldehyde dehydrogenase  62.48 
 
 		 569 aa  695    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.664596 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3408  aldehyde dehydrogenase  62.85 
 
 		 542 aa  699    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.828845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2068  aldehyde dehydrogenase  58.88 
 
 		 542 aa  653    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.72096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2515  Aldehyde Dehydrogenase  61.24 
 
 		 539 aa  689    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2936  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  62.66 
 
 		 541 aa  661    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2492  aldehyde dehydrogenase  61.8 
 
 		 541 aa  685    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149114  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2693  aldehyde dehydrogenase  63.04 
 
 		 542 aa  702    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0789  aldehyde dehydrogenase  65.43 
 
 		 541 aa  728    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22040  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  62.41 
 
 		 534 aa  684    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1289  Aldehyde Dehydrogenase  61.52 
 
 		 541 aa  689    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.657181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2926  aldehyde dehydrogenase  61.54 
 
 		 539 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1087  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 540 aa  1106    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0798  Aldehyde Dehydrogenase  60.07 
 
 		 540 aa  677    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49950  Aldehyde dehydrogenase  61.55 
 
 		 541 aa  680    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1707  Aldehyde Dehydrogenase_  60.67 
 
 		 539 aa  680    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.595433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1033  aldehyde dehydrogenase  65.48 
 
 		 541 aa  730    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2516  Aldehyde Dehydrogenase  61.35 
 
 		 541 aa  677    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2144  aldehyde dehydrogenase  61.61 
 
 		 546 aa  704    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0301  gyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  63.75 
 
 		 545 aa  722    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1780  Aldehyde Dehydrogenase  62.41 
 
 		 560 aa  656    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.760997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34600  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  62.66 
 
 		 541 aa  660    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.204448 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5240  aldehyde dehydrogenase  62.85 
 
 		 542 aa  699    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1385  Aldehyde Dehydrogenase  57.71 
 
 		 524 aa  619  1e-176  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.354292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4869  aldehyde dehydrogenase  57.41 
 
 		 526 aa  610  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0146679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45780  Aldehyde dehydrogenase  63.04 
 
 		 459 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54378  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  46 
 
 		 588 aa  446  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  34.71 
 
 		 466 aa  249  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.99 
 
 		 482 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  34.21 
 
 		 482 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.11 
 
 		 475 aa  233  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  31.93 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.51 
 
 		 477 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.33 
 
 		 479 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  31.93 
 
 		 479 aa  228  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  31.3 
 
 		 479 aa  227  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  31.3 
 
 		 479 aa  227  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.3 
 
 		 479 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.3 
 
 		 479 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.3 
 
 		 479 aa  225  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  32.85 
 
 		 457 aa  225  2e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.3 
 
 		 479 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.3 
 
 		 479 aa  225  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.3 
 
 		 479 aa  223  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  34.79 
 
 		 476 aa  222  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  31.95 
 
 		 471 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  33.91 
 
 		 477 aa  217  5e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  32.45 
 
 		 475 aa  207  4e-52  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  32.12 
 
 		 472 aa  206  1e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  31.5 
 
 		 482 aa  189  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  30.07 
 
 		 480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  28.82 
 
 		 449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  29.82 
 
 		 477 aa  174  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  29.82 
 
 		 464 aa  169  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1454  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  28.19 
 
 		 480 aa  169  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278673  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  28.48 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  27.84 
 
 		 478 aa  167  5e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  28.7 
 
 		 475 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  27.59 
 
 		 468 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  27.99 
 
 		 486 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2985  Aldehyde Dehydrogenase  32.27 
 
 		 473 aa  163  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.837677  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  25.68 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  30.1 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6645  aldehyde dehydrogenase  30.39 
 
 		 492 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  31.7 
 
 		 483 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3488  Aldehyde Dehydrogenase  31.05 
 
 		 489 aa  160  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  28.33 
 
 		 475 aa  160  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  30.23 
 
 		 476 aa  160  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1774  aldehyde dehydrogenase  27.42 
 
 		 480 aa  160  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00658035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  29.58 
 
 		 480 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  26.12 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1120  aldehyde dehydrogenase  29.82 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000801479 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0764  aldehyde dehydrogenase  25.97 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2146  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.57 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  29.58 
 
 		 480 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  26.89 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  31.84 
 
 		 531 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0965  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  28.57 
 
 		 507 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  28.57 
 
 		 505 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  26.74 
 
 		 499 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  29.83 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6141  aldehyde dehydrogenase  30 
 
 		 492 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.435023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3157  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  27.74 
 
 		 484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0316898 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  28.11 
 
 		 493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  28.22 
 
 		 482 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3193  aldehyde dehydrogenase  28.06 
 
 		 484 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  28.93 
 
 		 467 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2475  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  28.69 
 
 		 498 aa  154  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55823  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2498  putative aldehyde dehydrogenase  29.17 
 
 		 470 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  28.75 
 
 		 482 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3822  Aldehyde Dehydrogenase  27.39 
 
 		 518 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.959646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>