207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2310 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2310  carboxylesterase  100 
 
 
222 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0300805  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2138  carboxylesterase  76.15 
 
 
234 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145278  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2312  carboxylesterase  72.52 
 
 
223 aa  340  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295169  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2265  carboxylesterase  72.94 
 
 
221 aa  334  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2337  carboxylesterase  72.94 
 
 
221 aa  334  5e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2701  carboxylesterase  69.37 
 
 
223 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1999  phospholipase/carboxylesterase family protein  72.02 
 
 
221 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2455  phospholipase/carboxylesterase  72.02 
 
 
221 aa  330  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1950  carboxylesterase  70.97 
 
 
223 aa  330  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000802695  normal  0.0250693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2626  carboxylesterase  68.02 
 
 
223 aa  327  6e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000180149  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1759  Carboxylesterase  68.47 
 
 
223 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000153879  hitchhiker  0.00754405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4278  putative carboxylesterase  70.32 
 
 
229 aa  323  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2670  carboxylesterase  71.36 
 
 
223 aa  322  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000549714  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1907  carboxylesterase  70.72 
 
 
226 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000226911  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2022  carboxylesterase  67.61 
 
 
226 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000559029  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2136  carboxylesterase  65.75 
 
 
224 aa  300  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000191828  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00152  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  52.02 
 
 
223 aa  238  5e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1514  carboxylesterase  49.32 
 
 
231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0210024  hitchhiker  0.000187448 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0345  carboxylesterase  50.23 
 
 
223 aa  227  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1674  carboxylesterase  49.77 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843799  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  45.7 
 
 
222 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2074  carboxylesterase  45.7 
 
 
236 aa  202  3e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.439919  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4182  carboxylesterase  48.2 
 
 
223 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  46.15 
 
 
227 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3782  carboxylesterase  43.58 
 
 
222 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  44.7 
 
 
248 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1454  phospholipase/carboxylesterase family protein  44.2 
 
 
223 aa  191  8e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.105501  normal  0.208922 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  47.47 
 
 
220 aa  190  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0395  Carboxylesterase  45.32 
 
 
231 aa  189  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1633  carboxylesterase  43.75 
 
 
223 aa  190  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2587  phospholipase/carboxylesterase  72.27 
 
 
124 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000792011  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0967  carboxylesterase  47.16 
 
 
221 aa  188  7e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000584217 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0531  phospholipase/carboxylesterase  47.47 
 
 
221 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1846  carboxylesterase  43.44 
 
 
225 aa  186  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0211  carboxylesterase  41.96 
 
 
226 aa  186  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3639  Carboxylesterase  46.05 
 
 
223 aa  184  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3258  phospholipase/carboxylesterase  41.67 
 
 
228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4297  carboxylesterase  45.95 
 
 
232 aa  181  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.378403  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  43.98 
 
 
220 aa  181  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1899  Carboxylesterase  42.66 
 
 
226 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1071  carboxylesterase  43.89 
 
 
219 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2130  carboxylesterase  43.78 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.939077  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1079  phospholipase/carboxylesterase  41.46 
 
 
250 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2608  carboxylesterase  42.79 
 
 
221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.758777  normal  0.53501 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  43.14 
 
 
222 aa  171  7.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3533  Carboxylesterase  44.78 
 
 
219 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.755115  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2197  carboxylesterase  42.66 
 
 
226 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610315  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0940  phospholipase/Carboxylesterase  39.63 
 
 
222 aa  170  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127105  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1307  phospholipase/carboxylesterase  42.13 
 
 
220 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839904  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  41.1 
 
 
228 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  41.1 
 
 
228 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  41.1 
 
 
228 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  41.1 
 
 
228 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  41.1 
 
 
228 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  41.1 
 
 
228 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0972  phospholipase/carboxylesterase  41.74 
 
 
218 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2404  carboxylesterase, putative  41.5 
 
 
319 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0171467  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0551  carboxylesterase protein  38.79 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315382  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1261  carboxylesterase  41.18 
 
 
224 aa  164  9e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11300  Carboxylesterase I  42.59 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1107  carboxylesterase  40.38 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.175918  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14080  carboxylesterase  44.88 
 
 
215 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3288  carboxylesterase  37.96 
 
 
222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1228  carboxylesterase  40.69 
 
 
224 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4377  phospholipase/carboxylesterase  40.38 
 
 
233 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1246  carboxylesterase  44.39 
 
 
215 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1254  carboxylesterase  40.64 
 
 
219 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3561  carboxylesterase  41.59 
 
 
219 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.839773 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02430  acyl-protein thioesterase-1, putative  35.56 
 
 
238 aa  149  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954051  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1113  phospholipase/carboxylesterase  38.12 
 
 
224 aa  149  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.668569  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52268  lysophospholipase  38.65 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0434  hypothetical protein  40 
 
 
219 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0903  carboxylesterase  40.38 
 
 
218 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.892603  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4553  carboxylesterase  39.91 
 
 
218 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1296  carboxylesterase  39.53 
 
 
218 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4429  carboxylesterase  39.53 
 
 
218 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.708757 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32853  predicted protein  37.85 
 
 
226 aa  144  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0410  hypothetical protein  40 
 
 
219 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2584  phospholipase/carboxylesterase family protein  63 
 
 
101 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83761  predicted protein  40.28 
 
 
233 aa  135  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.199859  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0035  carboxylesterase  33.8 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2561  phospholipase/Carboxylesterase  30.41 
 
 
229 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08748  Acyl-protein thioesterase 1 (EC 3.1.2.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASI2]  36.24 
 
 
239 aa  129  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1073  phospholipase/Carboxylesterase  35.15 
 
 
218 aa  118  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0959  phospholipase/carboxylesterase  34.36 
 
 
193 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.258344  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  33 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  33 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2641  phospholipase/carboxylesterase  31.78 
 
 
205 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419247  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4485  phospholipase/Carboxylesterase  34.07 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33720  predicted protein  28.94 
 
 
260 aa  82  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2351  phospholipase/carboxylesterase  30.95 
 
 
221 aa  82  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368946  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  29.67 
 
 
223 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1688  putative phospholipase / carboxylesterase  32.04 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00377416  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  30.87 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  31.1 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  28.21 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3420  phospholipase/Carboxylesterase  30.29 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1158  phospholipase/carboxylesterase  31.22 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0188854 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1326  phospholipase/carboxylesterase  33.9 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2724  phospholipase/carboxylesterase  27.59 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>