More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0788 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0788  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
258 aa  523  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3591  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  82.17 
 
 
259 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0647  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  82.17 
 
 
259 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3781  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  81.78 
 
 
259 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.303771  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3658  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  81.78 
 
 
259 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3189  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  82.03 
 
 
259 aa  441  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3926  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.22 
 
 
263 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0976  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  75.29 
 
 
271 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3859  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  75.69 
 
 
263 aa  400  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1079  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  76.13 
 
 
260 aa  391  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  76.92 
 
 
254 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1899  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.4 
 
 
265 aa  259  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.651881  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0270  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.44 
 
 
255 aa  236  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0805  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.59 
 
 
283 aa  210  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1084  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.64 
 
 
281 aa  198  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.19532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4316  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.17 
 
 
276 aa  179  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06045  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.27 
 
 
277 aa  172  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.89 
 
 
289 aa  168  9e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2041  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.5 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.833222  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12220  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.89 
 
 
281 aa  155  6e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000110554  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.82 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.83 
 
 
276 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.92 
 
 
270 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.35 
 
 
270 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.39 
 
 
262 aa  148  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.16 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0625  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.06 
 
 
261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.6 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.25 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1877  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.65 
 
 
261 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000288014  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.87 
 
 
265 aa  145  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.24 
 
 
260 aa  145  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.99 
 
 
291 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6749  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.63 
 
 
282 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.2 
 
 
274 aa  142  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2266  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.7 
 
 
310 aa  140  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3510  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.15 
 
 
265 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.905017  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.27 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.03 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2410  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.12 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.33 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2731  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.71 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.06 
 
 
296 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.06 
 
 
296 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.06 
 
 
296 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.06 
 
 
296 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.73 
 
 
257 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.06 
 
 
296 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.06 
 
 
296 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.87 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.86 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1135  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.2 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.31 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0994  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.84 
 
 
285 aa  138  7.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.101042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.71 
 
 
296 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0784627  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.22 
 
 
274 aa  138  8.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.625021  normal  0.213852 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.18 
 
 
291 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.6 
 
 
300 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.84 
 
 
280 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.71 
 
 
296 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0854  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.25 
 
 
266 aa  137  2e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.8 
 
 
291 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.25 
 
 
300 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.932329  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.43 
 
 
262 aa  135  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.04 
 
 
272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.25 
 
 
266 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.38 
 
 
273 aa  135  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.51 
 
 
301 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.07 
 
 
275 aa  135  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.55 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2330  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.89 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.486837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.25 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.77 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.55 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2649  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.63 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.635632  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.59 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2213  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.37 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.717518  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.26 
 
 
256 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.86 
 
 
256 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1227  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.5 
 
 
261 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0136152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.71 
 
 
276 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.82 
 
 
280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.8 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.08 
 
 
285 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.03 
 
 
264 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.3 
 
 
279 aa  132  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.49 
 
 
296 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.49 
 
 
296 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.05 
 
 
270 aa  131  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0523  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.69 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0161876  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2273  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.73 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0992  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.22 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.89 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.05 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.25 
 
 
290 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2219  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.14 
 
 
301 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321148  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.25 
 
 
290 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.16 
 
 
271 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.25 
 
 
290 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.47 
 
 
290 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>