More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0762 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4425  gamma-glutamyl phosphate reductase  78.07 
 
 		 415 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4238  gamma-glutamyl phosphate reductase  78.31 
 
 		 415 aa  653    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4285  gamma-glutamyl phosphate reductase  78.31 
 
 		 415 aa  653    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0081  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.18 
 
 		 415 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0151  gamma-glutamyl phosphate reductase  76.87 
 
 		 420 aa  667    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3849  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  75.42 
 
 		 415 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3942  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  75.9 
 
 		 415 aa  648    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0762  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 415 aa  847    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4057  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  75.66 
 
 		 415 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0115  gamma-glutamyl phosphate reductase  78.31 
 
 		 415 aa  653    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3015  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.9 
 
 		 415 aa  627  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4145  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.06 
 
 		 413 aa  617  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.11 
 
 		 416 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.16 
 
 		 418 aa  450  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.8 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.07 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.46 
 
 		 418 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.31 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.32 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.82 
 
 		 418 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.69 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.85 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.09 
 
 		 418 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.33 
 
 		 456 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.58 
 
 		 414 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.87 
 
 		 411 aa  410  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0321  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.93 
 
 		 435 aa  403  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155357  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.29 
 
 		 418 aa  398  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.16 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.8 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.91 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.66 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0291  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.17 
 
 		 425 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000393853  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0431  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.89 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.25 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1215  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.81 
 
 		 419 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1503  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.03 
 
 		 419 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690049  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.77 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.31 
 
 		 410 aa  382  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.38 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.83 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.97 
 
 		 420 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.43 
 
 		 416 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.76 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.96 
 
 		 418 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0441  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.62 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.91 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.06 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.96 
 
 		 421 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.53 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.1 
 
 		 418 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.1 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.09 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.55 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.83 
 
 		 415 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.87 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.77 
 
 		 418 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.1 
 
 		 418 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.32 
 
 		 415 aa  375  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.04 
 
 		 415 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  46 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1319  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.48 
 
 		 407 aa  374  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1633  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.26 
 
 		 419 aa  375  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565136  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0083  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.97 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.85 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.83 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1194  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.12 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.95 
 
 		 418 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.91 
 
 		 425 aa  372  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.57 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.3 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.52 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.28 
 
 		 418 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1469  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.34 
 
 		 421 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300791  normal  0.0287865 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  46.62 
 
 		 428 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1205  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.65 
 
 		 434 aa  365  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.96 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.44 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.78 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0284  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.43 
 
 		 417 aa  364  1e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.15 
 
 		 417 aa  364  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.88 
 
 		 429 aa  364  1e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.27 
 
 		 423 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0212  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.67 
 
 		 427 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.95 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.17 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.79 
 
 		 426 aa  363  4e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2672  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.93 
 
 		 424 aa  363  4e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0269  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.31 
 
 		 429 aa  363  4e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303722  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0293  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.36 
 
 		 433 aa  362  6e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00187024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.26 
 
 		 432 aa  362  7.0000000000000005e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.97 
 
 		 423 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.2 
 
 		 422 aa  361  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0322  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.11 
 
 		 433 aa  361  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3516  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.4 
 
 		 420 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.34 
 
 		 446 aa  359  4e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.78 
 
 		 421 aa  359  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.3 
 
 		 425 aa  358  7e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>