More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4425 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_4285  gamma-glutamyl phosphate reductase  99.28 
 
 
415 aa  847    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0081  gamma-glutamyl phosphate reductase  87.23 
 
 
415 aa  740    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0115  gamma-glutamyl phosphate reductase  99.28 
 
 
415 aa  847    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0151  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.18 
 
 
420 aa  651    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3849  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  83.37 
 
 
415 aa  726    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3942  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  83.61 
 
 
415 aa  730    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0762  gamma-glutamyl phosphate reductase  78.07 
 
 
415 aa  659    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4425  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
415 aa  853    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4057  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  83.86 
 
 
415 aa  732    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4238  gamma-glutamyl phosphate reductase  99.52 
 
 
415 aa  849    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3015  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.9 
 
 
415 aa  629  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4145  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.62 
 
 
413 aa  609  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.53 
 
 
416 aa  454  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.18 
 
 
418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.82 
 
 
418 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.04 
 
 
418 aa  443  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.27 
 
 
418 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.69 
 
 
423 aa  427  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.93 
 
 
418 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.15 
 
 
418 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 
418 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 
418 aa  418  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 
418 aa  418  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.09 
 
 
414 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.66 
 
 
418 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.91 
 
 
418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0321  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.17 
 
 
435 aa  402  1e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155357  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.43 
 
 
456 aa  402  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.18 
 
 
418 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.52 
 
 
434 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.42 
 
 
420 aa  401  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.56 
 
 
416 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.52 
 
 
411 aa  395  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.56 
 
 
418 aa  397  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0291  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.17 
 
 
425 aa  396  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000393853  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.96 
 
 
421 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0441  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
423 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.8 
 
 
423 aa  388  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.62 
 
 
421 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.31 
 
 
418 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.36 
 
 
415 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.6 
 
 
415 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1215  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.68 
 
 
419 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.14 
 
 
421 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.52 
 
 
417 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.96 
 
 
418 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1633  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.51 
 
 
419 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565136  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.3 
 
 
418 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.3 
 
 
423 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.46 
 
 
427 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.3 
 
 
418 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.82 
 
 
423 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1503  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 
419 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690049  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.13 
 
 
425 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.99 
 
 
419 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.02 
 
 
423 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.6 
 
 
414 aa  375  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.32 
 
 
410 aa  375  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.28 
 
 
432 aa  374  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.54 
 
 
419 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.88 
 
 
424 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.11 
 
 
429 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.82 
 
 
423 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.13 
 
 
424 aa  370  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.96 
 
 
415 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.63 
 
 
425 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.73 
 
 
418 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.77 
 
 
417 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.3 
 
 
421 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.83 
 
 
424 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0431  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 
448 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.15 
 
 
435 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.17 
 
 
415 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  46.36 
 
 
428 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  47 
 
 
430 aa  368  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0257  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.19 
 
 
425 aa  368  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.56 
 
 
418 aa  366  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.18 
 
 
423 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.96 
 
 
429 aa  365  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  45.07 
 
 
419 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3804  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.53 
 
 
420 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.6 
 
 
421 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.12 
 
 
425 aa  366  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.59 
 
 
424 aa  368  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0227  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 
428 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.696628  normal  0.287759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.79 
 
 
426 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.55 
 
 
426 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.04 
 
 
426 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.03 
 
 
426 aa  363  3e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.06 
 
 
421 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.81 
 
 
418 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0212  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.16 
 
 
427 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.23 
 
 
430 aa  362  6e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.47 
 
 
419 aa  362  6e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3516  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.87 
 
 
420 aa  362  6e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1194  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.37 
 
 
420 aa  362  7.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.3 
 
 
446 aa  362  9e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1319  gamma-glutamyl phosphate reductase  46 
 
 
407 aa  361  1e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0083  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.45 
 
 
425 aa  361  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.05 
 
 
427 aa  360  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>