49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0480 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0480  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  728    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3720  hypothetical protein  68.99 
 
 		 346 aa  522  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.588173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3546  hypothetical protein  68.99 
 
 		 346 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.279975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4194  hypothetical protein  68.41 
 
 		 346 aa  518  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0410  hypothetical protein  68.99 
 
 		 346 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0450  hypothetical protein  71.01 
 
 		 346 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0436  hypothetical protein  71.01 
 
 		 346 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.574558  hitchhiker  0.00210413 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0511  hypothetical protein  70.72 
 
 		 346 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0424  hypothetical protein  70.72 
 
 		 346 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3890  hypothetical protein  70.72 
 
 		 346 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877982  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0466  hypothetical protein  64.66 
 
 		 351 aa  496  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3367  hypothetical protein  66.38 
 
 		 350 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3787  hypothetical protein  65.9 
 
 		 351 aa  488  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0533  hypothetical protein  65.8 
 
 		 350 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3197  hypothetical protein  62.72 
 
 		 346 aa  478  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2062  hypothetical protein  53.51 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4072  hypothetical protein  49.57 
 
 		 358 aa  354  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00822  hypothetical protein  51.46 
 
 		 348 aa  345  5e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001652  glycosyltransferase  52.63 
 
 		 348 aa  345  8e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1656  hypothetical protein  46.29 
 
 		 360 aa  329  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00119867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00208  glycosyl transferase  46.06 
 
 		 349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2984  hypothetical protein  46.04 
 
 		 354 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3289  hypothetical protein  42.4 
 
 		 366 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.60491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0795  hypothetical protein  40.35 
 
 		 345 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0695397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1681  hypothetical protein  39.36 
 
 		 347 aa  282  6.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0548  hypothetical protein  40.76 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0454  hypothetical protein  38.82 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1414  hypothetical protein  39.12 
 
 		 343 aa  266  5e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0675  hypothetical protein  37.86 
 
 		 343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2218  hypothetical protein  38.89 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1492  hypothetical protein  38.24 
 
 		 347 aa  256  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286308  normal  0.0796091 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3812  glycosyltransferase-distantly-related protein  35.26 
 
 		 346 aa  173  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4031  hypothetical protein  32 
 
 		 328 aa  149  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.510364  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2842  UDP-glucuronosyltransferase-like protein  27.78 
 
 		 371 aa  99.8  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0449  Glycosyltransferase 28 domain protein  26.89 
 
 		 377 aa  93.2  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0377577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0336  teichoic acid biosynthesis related protein  28.43 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  normal  0.581509 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1851  hypothetical protein  25.22 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.316148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6653  putative UDP-glucuronosyltransferase  25.8 
 
 		 359 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.109077 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0254  teichoic acid biosynthesis related protein  25.44 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0266168  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0253  teichoic acid biosynthesis related protein  25.3 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0243  teichoic acid biosynthesis related protein  25.15 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2563  UDP- glucuronosyltransferase-like glycosyl transferase  24.1 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0232  teichoic acid biosynthesis related protein  24.27 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.422227  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1235  teichoic acid biosynthesis related protein  24.16 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3660  putative glycosyltransferase  22.9 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359283  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2719  teichoic acid biosynthesis related protein  23.62 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.194172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2254  teichoic acid biosynthesis related protein  23.78 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.060696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5685  Glycosyl transferase-like protein UDP- glucuronosyltransferase  21.24 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2159  glycosyltransferase family 28 protein  20.64 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188732  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>