25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0451 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0451  kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 418 aa  862    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0493  kelch repeat-containing protein  58.61 
 
 		 376 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01192  kelch motif domain protein  47.07 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187168  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3966  kelch domain-containing protein  45.11 
 
 		 402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0984  kelch repeat-containing protein  42.98 
 
 		 358 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0397  kelch repeat-containing protein  71.6 
 
 		 162 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  27.75 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0398  hypothetical protein  61.36 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1205  N-acetylneuraminic acid mutarotase  21.05 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  0.260259 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  32.54 
 
 		 1762 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  29.51 
 
 		 508 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1195  N-acetylneuraminic acid mutarotase  20.88 
 
 		 386 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1240  N-acetylneuraminic acid mutarotase  21.05 
 
 		 380 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187343  normal  0.36338 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  24.6 
 
 		 812 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1225  N-acetylneuraminic acid mutarotase  20.88 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal  0.60575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  25.88 
 
 		 339 aa  47.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  23.66 
 
 		 321 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  24.73 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  33.71 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  22.82 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  29.41 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  23.74 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  28.68 
 
 		 990 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  25.61 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1371  hypothetical protein  29.25 
 
 		 356 aa  43.9  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>