More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2309 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2262  phosphomannomutase  68.57 
 
 
478 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033572 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2422  putative phosphomannomutase  99.79 
 
 
477 aa  980    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2208  putative phosphomannomutase  99.37 
 
 
477 aa  973    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11518  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2311  putative phosphomannomutase  98.95 
 
 
477 aa  974    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2309  putative phosphomannomutase  100 
 
 
477 aa  983    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0454655 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00703  phosphomannomutase  60.22 
 
 
472 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0769  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  61.97 
 
 
475 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.934178  normal  0.109685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2889  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  60 
 
 
474 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1329  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  60.81 
 
 
472 aa  549  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117788  decreased coverage  0.000167775 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1902  Phosphomannomutase  49.35 
 
 
473 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1733  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  47.32 
 
 
469 aa  420  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000017319  normal  0.274178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3809  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.94 
 
 
517 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4824  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.54 
 
 
499 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921542  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3790  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.57 
 
 
510 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3231  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.89 
 
 
490 aa  356  3.9999999999999996e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0401358  normal  0.764695 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0943  phosphomannomutase, putative  43.04 
 
 
483 aa  348  9e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774465  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1061  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.04 
 
 
484 aa  348  9e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.799252  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.99 
 
 
474 aa  341  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431398  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0126  phosphomannomutase  43.64 
 
 
481 aa  339  5.9999999999999996e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0540  putative phosphomannomutase  39.96 
 
 
467 aa  333  4e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3242  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  41.98 
 
 
474 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2993  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.55 
 
 
474 aa  326  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0348  phosphoglucomutase, putative  40.61 
 
 
477 aa  319  7e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.896466  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0537  phosphomannomutase, putative  39.25 
 
 
445 aa  310  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1234  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.07 
 
 
469 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.565449  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4052  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  42.7 
 
 
469 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4097  hypothetical protein  41.96 
 
 
466 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.909897  normal  0.207612 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4216  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.83 
 
 
465 aa  286  5.999999999999999e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  39.79 
 
 
499 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  34.21 
 
 
1553 aa  269  7e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  26.26 
 
 
449 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  30.72 
 
 
483 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  26.36 
 
 
450 aa  104  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  26.96 
 
 
430 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  26.19 
 
 
448 aa  101  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  26.68 
 
 
460 aa  100  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  26.11 
 
 
430 aa  100  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  26.1 
 
 
449 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1807  phosphoglucosamine mutase  26.48 
 
 
446 aa  97.8  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  26.85 
 
 
449 aa  97.1  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  23.72 
 
 
433 aa  96.7  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  26.11 
 
 
430 aa  96.7  8e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0742  phosphoglucosamine mutase  26.69 
 
 
446 aa  96.3  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0785  phosphoglucosamine mutase  25.93 
 
 
453 aa  96.3  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  25.53 
 
 
459 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  25.75 
 
 
448 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  25.75 
 
 
448 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1152  phosphoglucosamine mutase  25.36 
 
 
448 aa  95.9  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00023632  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0852  Phosphoglucosamine mutase  26 
 
 
454 aa  94.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198816  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0084  Phosphoglucosamine mutase  23.78 
 
 
454 aa  94.4  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0667  hypothetical protein  25.89 
 
 
419 aa  94  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  24.36 
 
 
448 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  25.54 
 
 
448 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  25.54 
 
 
448 aa  93.6  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  25.54 
 
 
448 aa  93.6  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  25.54 
 
 
448 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  27.51 
 
 
445 aa  93.6  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  23.8 
 
 
458 aa  93.6  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  25.54 
 
 
448 aa  93.6  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  25.54 
 
 
448 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  25.05 
 
 
480 aa  93.2  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1973  phosphoglucosamine mutase  27.87 
 
 
451 aa  93.2  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0100286 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  25.32 
 
 
448 aa  93.2  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  24.1 
 
 
452 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  25.32 
 
 
448 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0383  phosphoglucosamine mutase  25.58 
 
 
451 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1597  phosphoglucosamine mutase  25.35 
 
 
445 aa  91.7  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  26.53 
 
 
455 aa  91.7  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  25.81 
 
 
453 aa  90.9  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  25.05 
 
 
449 aa  90.5  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  25.54 
 
 
448 aa  90.5  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1567  phosphoglucosamine mutase  26.79 
 
 
445 aa  90.1  7e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  27.51 
 
 
459 aa  90.5  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1789  phosphoglucosamine mutase  24.24 
 
 
446 aa  90.1  8e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1188  Phosphoglucosamine mutase  25.42 
 
 
455 aa  89.4  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0409  phosphoglucosamine mutase  25.35 
 
 
445 aa  89.7  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0586  phosphoglucosamine mutase  26.16 
 
 
453 aa  89.7  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0187  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  24.46 
 
 
439 aa  89.7  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.117639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  26.47 
 
 
449 aa  89.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  24.95 
 
 
450 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  32.05 
 
 
445 aa  89  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  27.68 
 
 
448 aa  88.6  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  25.33 
 
 
434 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  25.94 
 
 
450 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2839  phosphoglucosamine mutase  25.89 
 
 
453 aa  88.6  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0388  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  24.85 
 
 
470 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477012  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  27.5 
 
 
450 aa  87.8  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  25.52 
 
 
451 aa  88.2  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1135  phosphoglucosamine mutase  26.34 
 
 
458 aa  87.8  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1967  phosphoglucosamine mutase  24.17 
 
 
446 aa  87.8  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000194402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  25.05 
 
 
451 aa  87.4  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  26.81 
 
 
452 aa  87.4  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1664  phosphoglucosamine mutase  25.8 
 
 
444 aa  87.4  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.194728 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  28.23 
 
 
447 aa  87  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  26.37 
 
 
445 aa  86.7  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2013  phosphoglucosamine mutase  26.79 
 
 
443 aa  86.7  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.993566  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0375  phosphoglucosamine mutase  26.99 
 
 
448 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  26.92 
 
 
450 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  27.08 
 
 
445 aa  86.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1248  phosphoglucosamine mutase  27.95 
 
 
447 aa  86.3  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>