204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2138 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2138  carboxylesterase  100 
 
 		 234 aa  482  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145278  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2310  carboxylesterase  76.15 
 
 		 222 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0300805  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2670  carboxylesterase  75.12 
 
 		 223 aa  347  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000549714  hitchhiker  0.00990238 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1950  carboxylesterase  74.19 
 
 		 223 aa  345  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000802695  normal  0.0250693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2701  carboxylesterase  73.3 
 
 		 223 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2312  carboxylesterase  73.73 
 
 		 223 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0295169  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1999  phospholipase/carboxylesterase family protein  72.48 
 
 		 221 aa  334  5.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1759  Carboxylesterase  72.4 
 
 		 223 aa  332  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000153879  hitchhiker  0.00754405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2626  carboxylesterase  72.4 
 
 		 223 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000180149  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2337  carboxylesterase  73.49 
 
 		 221 aa  332  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2455  phospholipase/carboxylesterase  73.49 
 
 		 221 aa  329  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2265  carboxylesterase  73.02 
 
 		 221 aa  328  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4278  putative carboxylesterase  69.09 
 
 		 229 aa  328  4e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1907  carboxylesterase  72.48 
 
 		 226 aa  327  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000226911  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2022  carboxylesterase  68.61 
 
 		 226 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000559029  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2136  carboxylesterase  69.12 
 
 		 224 aa  315  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000191828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00152  putative phospholipase/carboxylesterase family protein  53.02 
 
 		 223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0345  carboxylesterase  52.97 
 
 		 223 aa  235  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1514  carboxylesterase  50.23 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0210024  hitchhiker  0.000187448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3782  carboxylesterase  47.3 
 
 		 222 aa  215  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1674  carboxylesterase  50.23 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843799  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0108  phospholipase/carboxylesterase family protein  46.54 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237023  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2074  carboxylesterase  46.33 
 
 		 236 aa  207  8e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.439919  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4182  carboxylesterase  47.3 
 
 		 223 aa  198  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0395  Carboxylesterase  46.53 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2587  phospholipase/carboxylesterase  76.47 
 
 		 124 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000792011  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1846  carboxylesterase  45.79 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2608  carboxylesterase  47.6 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.758777  normal  0.53501 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2412  phospholipase/carboxylesterase  42.92 
 
 		 227 aa  188  5.999999999999999e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3258  phospholipase/carboxylesterase  42.01 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0211  carboxylesterase  45 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1272  Carboxylesterase  47.47 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0054  carboxylesterase  45.12 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.691003  normal  0.104617 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1454  phospholipase/carboxylesterase family protein  45.37 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.105501  normal  0.208922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1633  carboxylesterase  46.12 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846065 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0967  carboxylesterase  47.11 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3639  Carboxylesterase  45.71 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0531  phospholipase/carboxylesterase  46.54 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1107  carboxylesterase  43.78 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.175918  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  43.32 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3533  Carboxylesterase  43.12 
 
 		 219 aa  174  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.755115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4297  carboxylesterase  45.66 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.378403  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1261  carboxylesterase  41.07 
 
 		 224 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2404  carboxylesterase, putative  43.14 
 
 		 319 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0171467  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3402  carboxylesterase  44.28 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1899  Carboxylesterase  42.79 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0365567  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1167  carboxylesterase, putative  43.14 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00098882  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1610  phospholipase/carboxylesterase  43.14 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.247692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0272  putative carboxylesterase  43.14 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0149548  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1942  phospholipase/carboxylesterase  43.14 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1958  phospholipase/carboxylesterase  43.14 
 
 		 228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0275939  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2107  carboxylesterase  43.14 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.213325  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1228  carboxylesterase  40.91 
 
 		 224 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1307  phospholipase/carboxylesterase  44.5 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2197  carboxylesterase  42.53 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610315  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14080  carboxylesterase  46.41 
 
 		 215 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1071  carboxylesterase  43.58 
 
 		 219 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4377  phospholipase/carboxylesterase  43 
 
 		 233 aa  164  9e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11300  Carboxylesterase I  43.38 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0551  carboxylesterase protein  41.86 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315382  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2130  carboxylesterase  41.82 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.939077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3288  carboxylesterase  38.6 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0972  phospholipase/carboxylesterase  43.12 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0940  phospholipase/Carboxylesterase  38.97 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127105  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1254  carboxylesterase  42.66 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1113  phospholipase/carboxylesterase  39.32 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.668569  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32853  predicted protein  40.55 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1246  carboxylesterase  44.98 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1079  phospholipase/carboxylesterase  40.2 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_52268  lysophospholipase  38.76 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0903  carboxylesterase  40.37 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.892603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3561  carboxylesterase  39.27 
 
 		 219 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.839773 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02430  acyl-protein thioesterase-1, putative  35.17 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0954051  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4553  carboxylesterase  38.53 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2584  phospholipase/carboxylesterase family protein  66.67 
 
 		 101 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1296  carboxylesterase  38.53 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4429  carboxylesterase  38.53 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.708757 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08748  Acyl-protein thioesterase 1 (EC 3.1.2.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASI2]  39.07 
 
 		 239 aa  138  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0035  carboxylesterase  34.84 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2561  phospholipase/Carboxylesterase  34.31 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299124  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0434  hypothetical protein  35.85 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0410  hypothetical protein  35.85 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83761  predicted protein  38.1 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.199859  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1073  phospholipase/Carboxylesterase  32.39 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0959  phospholipase/carboxylesterase  32.82 
 
 		 193 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.258344  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2641  phospholipase/carboxylesterase  32.73 
 
 		 205 aa  98.6  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419247  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2351  phospholipase/carboxylesterase  35.53 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.368946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  33.17 
 
 		 204 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  33.17 
 
 		 204 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33720  predicted protein  30.64 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1688  putative phospholipase / carboxylesterase  31.9 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00377416  normal  0.0415953 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  29.38 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1845  phospholipase/Carboxylesterase  30.4 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4485  phospholipase/Carboxylesterase  32.86 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1158  phospholipase/carboxylesterase  30.84 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0188854 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  29.86 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2061  phospholipase/Carboxylesterase  26.96 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1386  phospholipase/carboxylesterase  31.92 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.167947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  30.05 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2462  phospholipase/Carboxylesterase  27.4 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>