More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1528 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1528  ATPase  100 
 
 		 318 aa  650    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  90.57 
 
 		 335 aa  596  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  90.88 
 
 		 318 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  90.88 
 
 		 318 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  90.88 
 
 		 318 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  90.88 
 
 		 318 aa  594  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  90.88 
 
 		 318 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  89.31 
 
 		 318 aa  591  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  89.31 
 
 		 318 aa  591  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  89.31 
 
 		 318 aa  591  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  88.92 
 
 		 316 aa  586  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  85.53 
 
 		 318 aa  567  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  83.96 
 
 		 318 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  85.53 
 
 		 318 aa  558  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  84.28 
 
 		 318 aa  556  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  82.39 
 
 		 318 aa  543  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  66.35 
 
 		 318 aa  449  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  65.52 
 
 		 318 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  63.55 
 
 		 333 aa  443  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  64.56 
 
 		 347 aa  434  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  65.19 
 
 		 318 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  62.78 
 
 		 321 aa  428  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  63.61 
 
 		 318 aa  428  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  63.87 
 
 		 319 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  63.87 
 
 		 319 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  64.87 
 
 		 318 aa  425  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  63.55 
 
 		 319 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  63.38 
 
 		 326 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  63.38 
 
 		 326 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  62.66 
 
 		 318 aa  425  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  62.7 
 
 		 319 aa  425  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  63.55 
 
 		 319 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  62.9 
 
 		 319 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  62.9 
 
 		 319 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  62.9 
 
 		 319 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  63.23 
 
 		 319 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  61.78 
 
 		 323 aa  411  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  64.84 
 
 		 319 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  61.34 
 
 		 320 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  61.66 
 
 		 331 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  61.66 
 
 		 331 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.49 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  60.38 
 
 		 339 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  56.74 
 
 		 326 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  58.97 
 
 		 324 aa  362  7.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.68 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  53.29 
 
 		 332 aa  353  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  54.26 
 
 		 321 aa  351  8e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2891  ATPase  54.43 
 
 		 325 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  51.12 
 
 		 320 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  54.02 
 
 		 325 aa  339  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  53.85 
 
 		 322 aa  333  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3798  ATPase  54.6 
 
 		 323 aa  331  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3058  ATPase  50.95 
 
 		 324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.27 
 
 		 331 aa  325  6e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  51.41 
 
 		 329 aa  325  8.000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  52.87 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  50.97 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  50.83 
 
 		 330 aa  320  3e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  53.44 
 
 		 331 aa  319  5e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  51.6 
 
 		 319 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.84 
 
 		 325 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  51.6 
 
 		 345 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.6 
 
 		 329 aa  317  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  49.04 
 
 		 325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.37 
 
 		 317 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  49.2 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  49.2 
 
 		 333 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  49.2 
 
 		 333 aa  309  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.59 
 
 		 318 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.73 
 
 		 350 aa  308  5.9999999999999995e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  49.51 
 
 		 333 aa  306  3e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0184  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.96 
 
 		 322 aa  305  6e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.914091  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  45.43 
 
 		 315 aa  305  9.000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0862  ATPase  50 
 
 		 330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0166086  normal  0.0307461 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.32 
 
 		 331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68175  normal  0.0266567 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  47.73 
 
 		 334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.68 
 
 		 333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  50 
 
 		 337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  49.51 
 
 		 340 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  50.97 
 
 		 339 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4008  ATPase  53.85 
 
 		 323 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  50.97 
 
 		 344 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0456  MoxR-like ATPase  54.55 
 
 		 318 aa  302  6.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  49.36 
 
 		 328 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  49.37 
 
 		 324 aa  301  7.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.22 
 
 		 327 aa  301  8.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3275  MoxR-like ATPase  53.51 
 
 		 323 aa  301  9e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.68 
 
 		 432 aa  299  4e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 353 aa  299  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  50 
 
 		 332 aa  298  8e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.9 
 
 		 336 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2472  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.28 
 
 		 335 aa  297  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.83519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  49.03 
 
 		 371 aa  296  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  52.27 
 
 		 345 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  49.35 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  53.51 
 
 		 332 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>