More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1661 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0798  glutamine synthetase, type I  74.37 
 
 
476 aa  773    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0671086  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1307  glutamine synthetase, type I  74.58 
 
 
476 aa  774    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00102635  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1710  glutamine synthetase, type I  78.57 
 
 
475 aa  811    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.102718  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1889  glutamine synthetase type I  74.79 
 
 
476 aa  786    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.489598  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0722  glutamine synthetase, type I  74.58 
 
 
476 aa  775    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000425202  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1007  glutamine synthetase  73.11 
 
 
476 aa  761    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.134746  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0276  glutamine synthetase, type I  78.36 
 
 
476 aa  798    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00270748  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1661  glutamine synthetase, type I  100 
 
 
476 aa  998    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000859271  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1446  glutamine synthetase, type I  77.1 
 
 
476 aa  796    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0279713  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1054  glutamine synthetase, type I  82.77 
 
 
475 aa  845    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  56.75 
 
 
469 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2577  glutamine synthetase, type I  56.42 
 
 
469 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1482  glutamine synthetase, type I  53.6 
 
 
486 aa  501  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.140298 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0109  glutamine synthetase, type I  53.32 
 
 
469 aa  497  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0159968 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3057  glutamine synthetase, type I  52.85 
 
 
477 aa  495  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0209  glutamine synthetase, type I  53.49 
 
 
469 aa  488  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692281  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03568  glutamine synthetase, type I  53.22 
 
 
467 aa  487  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.577755  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0988  L-glutamine synthetase  51.69 
 
 
473 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2375  glutamine synthetase  51.48 
 
 
469 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2503  L-glutamine synthetase  52.88 
 
 
469 aa  479  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2447  L-glutamine synthetase  52.22 
 
 
469 aa  480  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000663157  normal  0.627603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1544  L-glutamine synthetase  51.69 
 
 
469 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0013  L-glutamine synthetase  53.85 
 
 
471 aa  480  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.778405 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1677  glutamine synthetase, type I  53.79 
 
 
469 aa  476  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20708  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1004  glutamine synthetase, type I  51.48 
 
 
469 aa  478  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  51.27 
 
 
469 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0970  glutamine synthetase, type I  51.27 
 
 
469 aa  477  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.545228  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1582  glutamine synthetase, type I  53.78 
 
 
471 aa  475  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0243  L-glutamine synthetase  52.87 
 
 
469 aa  475  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0149  glutamine synthetase, type I  51.08 
 
 
470 aa  477  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0733  glutamine synthetase, type I  50 
 
 
469 aa  473  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.02678  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1920  glutamine synthetase, type I  51.27 
 
 
469 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1179  glutamine synthetase, type I  53.2 
 
 
471 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3259  glutamine synthetase, type I  53.76 
 
 
469 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1108  L-glutamine synthetase  50.42 
 
 
469 aa  474  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0181625  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1217  glutamine synthetase, type I  53.11 
 
 
471 aa  473  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1632  glutamine synthetase, type I  52.97 
 
 
471 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3834  L-glutamine synthetase  49.27 
 
 
473 aa  473  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1086  glutamine synthetase, type I  53.2 
 
 
471 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1736  glutamine synthetase, type I  51.27 
 
 
469 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.654979  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1258  glutamine synthetase protein  53.2 
 
 
471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3244  glutamine synthetase, type I  51.8 
 
 
468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0837  glutamine synthetase, type I  50.64 
 
 
473 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2057  L-glutamine synthetase  53.19 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.648979  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5458  L-glutamine synthetase  53.11 
 
 
471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3585  glutamine synthetase, type I  50.11 
 
 
471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110089  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2156  L-glutamine synthetase  48.95 
 
 
473 aa  470  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0673307 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1522  L-glutamine synthetase  51.92 
 
 
471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000686427  normal  0.138561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  50.53 
 
 
469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1025  glutamine synthetase  51.07 
 
 
469 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2087  glutamine synthetase, type I  50.42 
 
 
469 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0808  glutamine synthetase, type I  50.64 
 
 
473 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2615  glutamine synthetase, type I  52.35 
 
 
471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0119922  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2690  glutamine synthetase, type I  53.11 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1090  glutamine synthetase, type I  51.33 
 
 
469 aa  467  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.603235  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3315  glutamine synthetase, type I  50.11 
 
 
469 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651786  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1743  glutamine synthetase, type I  53.11 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0103435  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1124  glutamate--ammonia ligase  51.55 
 
 
469 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.453717  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1839  glutamine synthetase  50.21 
 
 
468 aa  468  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.724651  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1481  glutamine synthetase, type I  52.35 
 
 
471 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.494323  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  50.32 
 
 
469 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2770  glutamine synthetase, type I  53.11 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2652  glutamine synthetase type I  52.43 
 
 
469 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127344  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  50 
 
 
469 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0243  glutamine synthetase, type I  50.53 
 
 
475 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.823516  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1524  glutamine synthetase, type I  53.11 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1262  glutamine synthetase, type I  49.47 
 
 
474 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0975496  normal  0.0997444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2558  glutamine synthetase, type I  50.11 
 
 
469 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728767  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1184  glutamine synthetase, type I  50 
 
 
470 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103197 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0502  L-glutamine synthetase  51.91 
 
 
468 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01591  glutamine synthetase  51.55 
 
 
469 aa  467  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  50.11 
 
 
469 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3067  glutamine synthetase, type I  53.11 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2634  glutamine synthetase, type I  53.11 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2629  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 
474 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2253  glutamine synthetase, type I  53.11 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3077  glutamine synthetase, type I  50 
 
 
470 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00183784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2203  glutamine synthetase, type I  50 
 
 
473 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000380736 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2167  glutamine synthetase, type I  52.22 
 
 
471 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4575  glutamine synthetase, type I  47.96 
 
 
470 aa  462  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1122  glutamine synthetase, type I  52.44 
 
 
471 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744153  normal  0.286491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2076  L-glutamine synthetase  52.43 
 
 
472 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943231  normal  0.983586 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0988  L-glutamine synthetase  50.53 
 
 
474 aa  462  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0372208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  49.68 
 
 
469 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1265  glutamine synthetase type I  49.36 
 
 
473 aa  461  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2940  glutamine synthetase  50.64 
 
 
469 aa  464  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0626  glutamine synthetase, type I  51.39 
 
 
471 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1844  glutamine synthetase, type I  52.89 
 
 
471 aa  465  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.43293  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0466  glutamine synthetase, type I  51.39 
 
 
471 aa  464  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4400  glutamine synthetase, type I  49.57 
 
 
474 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.756911 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2386  glutamine synthetase, type I  49.89 
 
 
469 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35436  normal  0.41443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  50.95 
 
 
469 aa  461  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2062  L-glutamine synthetase  52.31 
 
 
471 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00147579  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5928  glutamine synthetase, type I  52.22 
 
 
471 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10271  glutamine synthetase, glutamate--ammonia ligase  50.21 
 
 
473 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.18298 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2186  glutamine synthetase, type I  52 
 
 
471 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.179605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2059  glutamine synthetase, type I  52 
 
 
471 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2149  glutamine synthetase, type I  52.22 
 
 
471 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0697  glutamine synthetase, type I  52.31 
 
 
471 aa  464  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.817374 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3648  glutamine synthetase, type I  52.43 
 
 
469 aa  462  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.663211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>