42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2949 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2949  hypothetical protein  100 
 
 		 714 aa  1456    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.211867 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0609  hypothetical protein  25.22 
 
 		 698 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  23.8 
 
 		 931 aa  100  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  22.12 
 
 		 897 aa  93.6  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2003  glycosyl hydrolase, BNR protein  26.25 
 
 		 661 aa  79.7  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.075614  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  25.12 
 
 		 614 aa  63.9  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2258  hypothetical protein  24.62 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.750001  hitchhiker  0.0000258604 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1140 aa  59.3  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1030 aa  58.9  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1446  glycosyl hydrolase  23.36 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  21.95 
 
 		 597 aa  58.9  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3165  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  20.8 
 
 		 299 aa  55.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401684  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2128  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.89 
 
 		 334 aa  55.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.437316  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2804  BNR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 344 aa  54.3  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1573  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.81 
 
 		 324 aa  54.3  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2000  BNR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 332 aa  53.5  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.177626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24310  BNR/Asp-box repeat-containing protein  23.99 
 
 		 365 aa  52  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2059  hypothetical protein  23.62 
 
 		 361 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0816093  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4866  hypothetical protein  34.04 
 
 		 329 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2227  Ycf48-like protein  23.57 
 
 		 333 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537914  normal  0.190318 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06030  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  28.67 
 
 		 516 aa  49.7  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25281  Ycf48-like protein  23.51 
 
 		 335 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6780  glycosyl hydrolase  23.74 
 
 		 324 aa  48.9  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2813  BNR domain-containing protein  25 
 
 		 320 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0172684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1547  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.95 
 
 		 630 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0887  hypothetical protein  24.19 
 
 		 350 aa  48.1  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0720354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4692  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  21.19 
 
 		 324 aa  48.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5660  hypothetical protein  21.73 
 
 		 742 aa  47.4  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1856  Ycf48-like protein  25.27 
 
 		 339 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3229  BNR domain-containing protein  24.45 
 
 		 338 aa  46.2  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1578  hypothetical protein  27.54 
 
 		 341 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0613836  normal  0.221478 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0584  hypothetical protein  25.65 
 
 		 315 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0424726  hitchhiker  0.000233592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2748  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.24 
 
 		 314 aa  45.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000496778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2970  hypothetical protein  28.06 
 
 		 343 aa  45.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0399  photosystem II stability/assembly factor-like protein  21.97 
 
 		 335 aa  45.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2197  BNR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 337 aa  44.7  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3778  BNR/Asp-box repeat protein  24.1 
 
 		 340 aa  44.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2065  uncharacterized protein related to photosystem II stability/assembly factor  20.45 
 
 		 382 aa  44.3  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1700  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  23.63 
 
 		 369 aa  44.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.601286  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1157  hypothetical protein  25.68 
 
 		 314 aa  43.9  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0816  Ycf48-like protein  24.35 
 
 		 334 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3430  BNR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 397 aa  43.9  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0324966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>