41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2618 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2618  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  330  6e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0431913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  30 
 
 		 643 aa  62.4  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  39.58 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  31.71 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.67 
 
 		 348 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  33.67 
 
 		 348 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  36.99 
 
 		 760 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  29 
 
 		 1085 aa  52  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  26.23 
 
 		 755 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  34.33 
 
 		 766 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  35.62 
 
 		 772 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  34.25 
 
 		 760 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  28.1 
 
 		 1351 aa  48.1  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  35.62 
 
 		 779 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  35.62 
 
 		 765 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  35.62 
 
 		 766 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  25.41 
 
 		 542 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  34.18 
 
 		 1070 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  34.18 
 
 		 1070 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  29.49 
 
 		 531 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  34.18 
 
 		 1112 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  27.72 
 
 		 1052 aa  46.6  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  31.58 
 
 		 1088 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  32.48 
 
 		 356 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  29.73 
 
 		 772 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  29.46 
 
 		 535 aa  44.7  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27 
 
 		 341 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  33.82 
 
 		 692 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  27.27 
 
 		 400 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  26.13 
 
 		 858 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.11 
 
 		 1679 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1389 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  30.3 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  27.7 
 
 		 993 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  35.19 
 
 		 789 aa  42  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  35.19 
 
 		 789 aa  42  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  29.13 
 
 		 994 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  26.47 
 
 		 539 aa  41.2  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  26.47 
 
 		 587 aa  41.2  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  29.03 
 
 		 995 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  25.25 
 
 		 399 aa  40.4  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.482168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>